ke konci Josefovy vlády skutečně narůstala nespokojenost. Náboženské prvky byly nespokojeny s mnoha jeho reformami a pánové i rolníci se obávali, co by jeho zemědělské změny znamenaly pro jejich budoucnost. Několik dalších politik navíc inspirovalo odpor., V roce 1784 byl informován, že maďarská vláda, že jeho oficiální jazyk, latina, není efektivní pro moderní vlády a od maďarské mluvilo pouze část obyvatel tohoto království, že jazyk vláda od té doby by to bylo německé. Tento jazyk by byl použit v centrálních úřadech okamžitě, v krajských úřadech po jednom roce a v místních úřadech po třech. Vládní zaměstnanost a dokonce i členství v maďarské stravě by bylo otevřené pouze německým řečníkům., Ačkoli to bylo navrženo tak, aby usnadnilo správu, mnoho Maďarů interpretovalo toto jazykové rozhodnutí jako hrozbu pro celou jejich kulturu a nadšeně se proti němu vyslovilo. Přidat do Maďarů horor, Josef odmítl předložit korunovace v Maďarsku, jinak se musí přísahám, že budu prosazovat zákony, které on nechtěl, a pak měl posvátnou korunu království se přestěhoval do Vídně.
do roku 1787 se zesiloval odpor vůči Josefovi a jeho vládě., Jeden Habsburský majetek, který unikl reformám za vlády Marie Terezie a Josefa, byl Rakouské Nizozemsko, které vládlo podle svých vlastních zákonů. V lednu a březnu 1787 Joseph jednoduše smetl ústavu rakouského Nizozemska a oznámil, že od té doby bude vládnout podle absolutistických principů, stejně jako ostatní provincie monarchie. Odpor vřelo v Rakouském Nizozemí až do roku 1789, kdy to překypělo v otevřenou vzpouru, nutí správy tam uprchnout do bezpečí ve velkovévodství., V té době se také objevily zvěsti o vzpouře v Maďarsku a v Haliči a po určitou dobu se zdálo, jako by revoluce mohla vypuknout v mnoha částech monarchie.
josefínských reforem nemusí vytvořili tolik opozice, kdyby to nebylo pro jeho zahraniční politiku. Joseph nebyl zvlášť agresivní v zahraničních záležitostech, ale řídil se Anti-pruskou radou svého a starého kancléře jeho matky, Kaunitz, a tato rada skončila neštěstí. Kaunitz pevně věřil, že Rakousko může kontrolovat Prusko pouze s pomocí Ruska., V roce 1781 proto s Josefem vyjednali s Kateřinou Velikou pakt, který poskytl ruské pomoci Rakousku v případě války s Pruskem. Výměnou Rakousko slíbilo pomoci Rusku v případě války s Osmanskou říší. Catherine, přesvědčená o své diplomatické a vojenské síle, se poté zapojila do řady provokací vůči Turkům, které vyústily v roce 1787 v vyhlášení války sultánem. Ačkoli Joseph neměl žádnou skutečnou touhu účastnit se této války, jeho smluvní závazky s Ruskem vyžadovaly, aby tak učinil. Zpočátku válka šla špatně., V roce 1788 Rakušané čekali na Rusy, aby se útok v rumunských zemích—což se jim nepodařilo udělat—jen aby byli sami napadeni Turky a poslal pobíhá na sever od Dunaje ve snaze reconsolidate jejich linky. Joseph sám byl přítomen na této kampani,která nikomu nic dobrého. Nemohl inspirovat své důstojníky, aby byli agresivnější, a stal se docela nemocným, natolik, že se na konci roku 1788 vrátil do Vídně ve snaze zotavit se., Kampaň v roce 1789 odešel mnohem lepší, což v Rakouské dobytí důležité pevnosti Bělehradu na soutoku řek Sáva a Dunaj a ve společném Rakousko-ruské ofenzívy v Moldávii a Valašsko, že jel Turky až k Dunaji.
ale do této doby na něj dopadaly všechny nešťastné důsledky Josefovy domácí i zahraniční politiky. Válka sama způsobila vylití populární agitace proti jeho zahraniční politiky, lidé z Rakouského Nizozemí vzrostl v naprosté revoluci, a zprávy o potížích v Haliči zvýšil., Nakonec to bylo Maďarsko, které zlomilo Josephova ducha. V roce 1788 musel svolat staré krajské shromáždění, aby požádal o rekruty a zásoby pro boj proti válce. Šlechtici, kteří tvořili tyto shromáždění, odpověděli protesty a požadavky na obnovení staré ústavy a na to, aby se Josef podrobil korunovaci tradičním maďarským způsobem. Dokonce i maďarské kancléřství, ministerstvo ústřední vlády odpovědné za maďarské záležitosti, doporučilo Josephovi splnit tato přání svých voličů.,
tváří v tvář těmto potížím Joseph zrušil mnoho reforem, které dříve přijal. V dopise z ledna 1790 zdůraznil, že jeho dobré úmysly v přijetí jeho nové zákony v Maďarsku a pak se zruší všechny z nich s výjimkou Edikt Tolerance, zákony týkající se postavení rolníků, a klášterní reformy. Souhlasil s tím, že vzhledem k nebezpečné mezinárodní situaci zavolá maďarskou stravu—ale ne příliš brzy-a souhlasil s návratem koruny do Maďarska a k vlastní korunovaci krále této země., Korunování se však nikdy nedostalo, protože Joseph zemřel následující měsíc.