samaan aikaan viranomaiset joen molemmin puolin liittyivät liittovaltion viranomaisiin tutkimaan tapausta. Niiden tutkinta johti lopulta Joe Flachs, vanha ystävä Scott on. Flachs kertoi viranomaisille, että Scott oli kertonut hänelle, että hän oli murtunut pato, jotta hän voisi strand hänen vaimonsa, Suzie, Missourin puolella jokea. Suzie työskenteli tarjoilijana rekkapysäkillä Taylorissa Missourissa. Tarinan edetessä Scott halusi olla vapaa bilettämään, kalastamaan ja seurustelemaan., Tutkijat löysivät myöhemmin muita todistajia, jotka sanoivat Scottin kerskuneen Vallin murtamisesta juhlissa vedenpaisumuksen jälkeen. Todisteiden perusteella Scott vietiin Missouriin oikeuteen marraskuussa 1994.
Scott joutui oikeuteen vuoden 1979 Missourin lain nojalla, jonka mukaan oli rikos aiheuttaa tahallaan katastrofi. Laki on kodifioitu 569 Pykäläksi.,070 Missouri Tarkistettu Perussääntö, jotka on määritelty katastrofi kuin ”kuoleman tai vakavan fyysisen vamman kymmenen tai enemmän ihmisiä tai huomattavaa vahinkoa viisi tai useampia rakennuksia tai asuttava rakenteita tai huomattavaa vahinkoa elintärkeä julkinen laitos, joka vakavasti heikentää sen hyödyllisyyttä tai toimintaa.”Oikeudenkäynti tapahtui julkisuuden vuoksi Kirksvillessä 109 kilometriä Länsi-Quincystä länteen.
Syyttäjät ja tutkijat uskoivat, että Scott joko poistaa tai leikata levyt, joka kattaa levee, niin burrowed hiekan läpi, kunnes vesi ryntäsi sisään., Puolustus lepäsi pitkälti kahden maaperä-tieteen asiantuntijoita, jotka todistivat, siellä oli vahvaa näyttöä siitä, levee epäonnistui, koska luonnolliset syyt: David Hammer of the University of Missouri sanoi, että siellä oli ollut ”jotain 11 tai 12 levee epäonnistumisia” ylävirtaan West Quincy, ja Charles Morris University of Missouri-Rolla sanoi viime hetken päätös tuoda puskutraktorit pönkittää levee itse asiassa heikentynyt sen rakenteellinen eheys. Syyttäjä esitti lukuisia todistajia, jotka väittävät kuullut Scott bragging rikkoo levee, ja viittasi epäjohdonmukaisuuksia hänen tarinansa.,
kolmen päivän oikeudenkäynnin jälkeen valamiehistö harkitsi neljän tunnin ajan ja tuomitsi Scottin sitten katastrofin aiheuttamisesta. Kuukautta myöhemmin, hänet tuomittiin 10 vuodeksi vankilaan, ajaa peräkkäin hänen 10-vuoden murron lause Illinois.
Scott valitti tuomiosta, ja 25.helmikuuta 1997 Missourin vetoomustuomioistuin hylkäsi tuomion syyttäjänvirheen vuoksi. Syyttäjät eivät olleet kertoneet puolustukselle kahdesta todistajasta, joiden kerrotaan kuulleen Scottin sanoneen hänen rikkoneen vallia tahallaan., Hänet vangittiin uudelleen vuonna 1998 ja tuomittiin toisen kerran kolmen tunnin harkinnan jälkeen 30.huhtikuuta. Alkuperäinen virke palautettiin 6.heinäkuuta.
Scott istuu parhaillaan tuomiotaan Jefferson City Correctional Centerissä Missouri Department of Corrections ID #1001364: n alaisuudessa. Mukaan syyskuun 8, 2017 ”Criminal” podcast episodi nimeltään ”katastrofi”, joka sisältää Scott, hän on oikeutettu ehdonalaiseen vuonna 2023. Hän pitää kiinni syyttömyydestään.
Adam Pitluk, entinen ajan toimittaja, kirjoitti kirjan Damned to Eternity väittäen Scottin olevan syytön.