Baez uran läpi 1980-ja 1990-luvulla
myöhempinä vuosina Baez on laulu-uransa horjui, vaikka eri yritykset elvyttää sitä. Hänen vuoden 1985 ponnistuksensa sisälsi sovinnaisemman
jäljentää luvalla
.
kampaus ja vaatetus., Hänen kannattajansa uskoivat hänen saavan takaisin näkyvyyden viihdeteollisuudessa, koska hänen äänellään, vaikkakin syvemmällä, oli samat ominaisuudet, jotka tekivät hänestä niin menestyksekkään aiemmin. Samaan aikaan, hän oli melko kiireinen koko maailman johtajana Humanitas Kansainvälisten Ihmisoikeuksien Komitea, joka keskittyy häiritsevää (mahdolliset väkivallaton tapa) niille, joille se uskoi käyttänyt luvattoman valtaa.
Baez on jatkanut musiikin tekemistä ja vaikuttanut nuorempiin esiintyjiin. Vuonna 1987 Baez julkaisi vastikään ensimmäisen studioalbuminsa kahdeksaan vuoteen., Hän oli ehdolla vuoden 1988 Paras Contemporary Folk Tallennus Grammy-Palkinnon ”Asimbonanga,” laulu albumilta. Myös vuonna 1988 Baez levytti timantteja ja ruostetta härkätaistelussa Espanjan Bilbaossa. Albumi julkaistiin seuraavana huhtikuussa. Vuonna 1990 Baez kiersi Indigo Girls ja kolmikko oli kirjattu Public Broadcasting Service (PBS), videoesitys, ”Joan Baez In Concert.,”Vuonna 1993 kaksi Baez tallenteet olivat julkaisupäivä: Pelata Minua Taaksepäin, joka koostuu uutta materiaalia; ja Harvinaisia, Live & Klassinen, kokoelma hänen uransa vuodesta 1958 vuoteen 1989, jossa on kaksikymmentä-kaksi aiemmin julkaisematonta. Baez julkaisi Gone from Dangerin vuonna 1997 ja jäähyväiset Angelinalle vuonna 2002.
myös laulajan kiinnostus politiikkaan ja ihmisoikeuksiin on jatkunut. Vuonna 1993 Refugees International kutsui hänet matkustamaan Bosnia-Hertsegovinaan auttaakseen kiinnittämään huomiota sikäläisiin kärsimyksiin., Syyskuussa samana vuonna Baez tuli ensimmäinen suuri taiteilija suorittaa ammatillinen konsertti Alcatraz (entinen Federal Penitentiary) San Franciscossa, Kaliforniassa. Se oli hänen siskonsa Mimi Farinan järjestölle”Bread & Roses ” – hyväntekeväisyysesitys. Hän palasi saarelle toinen hyöty vuonna 1996 yhdessä Indigo Girls ja Dar Williams. Hän on myös tukenut homojen ja lesbojen aiheuttaa. Vuonna 1995 hän liittyi Janis Ian suorituskyky National Gay and Lesbian Task Force on Taistella rahankeruu tapahtuma San Franciscossa.,
vuonna 2001 Farrar, Straus ja Giroux julkaisivat David Hajdun positiivisesti neljännen kadun. Kirja on intiimi muotokuva, joka tutkii suhteita Joan, Mimi Farina, Richard Farina, ja mies folkster Bob Dylan (1941–) aikana New Yorkin folk kohtaus 1960-luvun alussa.