ahogy a legtöbb nempoláris lipid esetében igaz volt, a poláris lipidek szerkezete a zsírsavak glicerinnel való kondenzációján alapul. A fő különbség az, hogy a glicerin három OH csoportja közül csak kettő vesz részt. A harmadikat egy erősen poláris molekulával kombináljuk:

ahol X lehet számos funkcionális csoportok, mint például a kolin, glicerin, etanolamin, szerin, a példa adtunk. Ez ad egy szerkezet, ahol van egy erősen poláris fej csoport, két hosszabb, nem poláris zsírsav lánc farok. Ez a szerkezet gyakran általánosítható rajzfilm formában is látható ábra \ (\PageIndex{1}\).egy értelemben a poláris lipidek olyanok, mint a zsírsavak anionjai, csak még inkább. Két hidrofób szénhidrogén-farokot és egy fejet tartalmaznak, amelyeknek több elektromosan töltött helye is lehet., Mint a szappan-és mosószermolekulák esetében, a poláris lipidek farkai általában elkerülik a vizet és más poláris anyagokat, de a fejek nagyon kompatibilisek az ilyen környezetekkel.

a poláris lipidek leggyakrabban a sejtfalak és más membránok összetevőiként fordulnak elő. A membránszerkezetre vonatkozó szinte minden hipotézis alapvető összetevőként egy lipid kétréteget vesz fel (\(\PageIndex{2}\))., A laboratóriumban készült kétrétegeknek számos tulajdonsága van a membránokkal. Az olyan ionok, mint a Na+, K + és Cl – nem tudnak áthaladni rajtuk, de a vízmolekulák képesek. Az ilyen kétrétegű szénhidrogénmagnak nagy elektromos ellenállással kell rendelkeznie, mint egy membrán. Bizonyos hordozómolekulák k+ – t és más ionokat szállíthatnak egy kétrétegű rétegen keresztül, úgy tűnik, hogy körülöttük egy hidrofób köpenyt csomagolnak, hogy elrejtsék a töltéseiket. A kétrétegű membránfehérjék lehetővé teszik ionok és más molekulák szállítását a kétrétegű rétegen keresztül, amelyek egyébként nem tudnak áthaladni.