Többpárti választások előkészületei déli függetlenség
Az ICC parancs úgy tűnt, hogy kis hatással Bashir népszerűsége Szudánban, majd 2010 áprilisában volt újraválasztották elnöknek, mintegy 68% – a a szavazás az ország első többpárti választások több, mint 20 éve., Salva Kiir, aki Bashir alatt Nemzeti első alelnökként és a félig autonóm kormány elnökeként szolgált Dél-Szudánban John Garang 2005-ös halála óta, a szavazatok csaknem 93% – át kapta, hogy továbbra is ebben a minőségben szolgáljon. A választási eredményeket elhomályosította Bashir két fő ellenzéki jelöltjének visszavonása a verseny előtt, aki azt állította, hogy már vannak jelek a csalárd gyakorlatokra, és néhány nemzetközi megfigyelő nyilatkozata szerint a választások elmaradtak a nemzetközi normáktól.,
a 2005-ös CPA feltételei szerint a dél-szudáni állampolgárok 2011. január 9-15-én szavaztak a déli függetlenségről szóló, várva várt népszavazáson. Néhány elszigetelt erőszakos incidensen kívül a népszavazás békésen zajlott, a nemzetközi megfigyelők pedig hitelesnek, nagyrészt szabadnak és igazságosnak nyilvánították a szavazást., A másik népszavazást eredetileg az Abyei régió lakosai számára egyidejűleg tervezték, azzal kapcsolatban, hogy ez a régió északi vagy déli részét képezi-e abban az esetben, ha az utóbbi a függetlenséget választotta, határozatlan időre elhalasztották a régióban a választói jogosultsággal kapcsolatos nézeteltérések miatt.
A január végén közzétett déli függetlenségi népszavazás előzetes eredményei azt mutatták, hogy a szavazók csaknem 99 százaléka az északról való elszakadás mellett döntött; ezt megerősítette a végleges eredmények februári bejelentése., Az ország ezután a 2011.július 9-re tervezett déli elszakadás végső előkészületeire nézett. A felosztás előkészítése azonban nem ment simán. Ahogy a júliusi függetlenségi dátum egyre közelebb került, számos kulcsfontosságú kérdés megoldatlan maradt Észak és dél között, mint például az ország olajvagyonának megosztása, az ország kollektív adósságának elosztása, valamint a végső határhatár meghatározása.
a megoldatlan határkérdéssel kapcsolatban riasztó helyzet alakult ki a vitatott Abyei térségben., A 2005-ös CPA értelmében a régiót Észak-és Dél-Szudán közösen igazgatta mindaddig, amíg végleges státusza meg nem határozható, amely az Abyei népszavazás határozatlan idejű elhalasztásával még függőben volt. Abyeiben szétszórt mennyiségű alacsony szintű erőszak volt, de a feszültségek új magasságot értek el 2011 májusában, amikor Bashir elrendelte a régió elsődleges városának, más néven Abyei invázióját., Szerinte az invázió indokolt válasz volt a déli provokációra, hivatkozva arra, hogy a déli harcosok néhány nappal korábban megtámadták az északi erőket és az ENSZ békefenntartó csapatait, de az inváziót nemzetközi körökben széles körben elítélték, és tiltakozó kiáltásokat váltott ki a dél-szudáni kormánytól. Abyei lakosok tízezreit kényszerült elhagyni a konfliktus., Nappal később, amikor Bashir hirdette Abyei, hogy észak-földet, de nem volt hajlandó visszavonni az északi csapatok, sokan attól tartottak, hogy a fűtött helyzet feltüzelni polgárháború, az ország, de megállapodás született a június, hogy amennyiben egy új, ideiglenes észak-déli közigazgatás, a régió, valamint a visszavonásának, mind az északi, mind a déli erők a régióban. Az etióp békefenntartó csapatok megállapodtak abban, hogy ideiglenes biztonsági erőt hoznak létre Abyei számára.,
Meanwhile, another conflict had developed in the central Sudanese state of Southern Kordofan, which shared a border with the soon-to-be-independent south., Bár technikailag az északi része az ország Déli Kordofan otthon volt a Nuba emberek több ezer harcos, aki szövetségre léptek a déli a polgárháború alatt; az állam is tartott sok az olaj fenntartja, hogy benne maradnak az északi után dél-Szudán függetlensége. A déli erők és a Szudáni hadsereg közötti harcok június elején törtek ki, mindkét fél az összecsapások felbujtásával vádolta a másikat, és az ellenségeskedések fokozódtak, amikor a Szudáni hadsereg erőszakos kampányt indított annak érdekében, hogy véget vessen annak, amit lázadásnak tartottak., A konfliktus számos polgári áldozatot követelt, és az állam lakosságának széles körű kiszorítását eredményezte. Június végén az AU megállapodást kötött a szudáni kormány és a Dél-Kordofáni ellenzéki párt, az SPLM (később SPLM-North) között a harcok befejezéséről és az északiak státuszának kezeléséről, akik a dél oldalán harcoltak a polgárháború alatt, biztosítva a leszerelést vagy a Szudáni hadseregbe való integrációt., A megállapodás kiterjed a szomszédos Kék-Nílus államra is, amely bár nem volt olyan erőszakos, mint a Dél-Kordofanban, sok korábbi déli harcos otthona volt.
a közelmúltbeli ellenségeskedések és a fennmaradó megoldatlan szecessziós kérdések erősen növekedtek, amikor a dél tervezett függetlenségi dátuma közelebb került., Kevesebb mint egy héttel a dél elszakadása előtt az észak és a dél megállapodott abban, hogy folytatja a megbeszéléseket megoldatlan kérdéseikről—ideértve az olajbevételek megosztásának kulcsfontosságú kérdéseit és a határ végső határzárat -, miután a dél kinyilvánította függetlenségét. A déli elszakadásra 2011.július 9-én került sor.