Restrikciós fragmentum hossza polimorfizmus

az rflps kimutatásának alapvető technikája magában foglalja a DNS-minta fragmentálását egy restrikciós enzim alkalmazásával, amely szelektíven hasíthatja a DNS-molekulát, ahol egy rövid, specifikus szekvenciát felismernek egy restrikciós emésztésként ismert folyamatban. Az emésztés által termelt DNS-fragmenseket ezután hosszirányban elválasztják egy agaróz gélelektroforézis néven ismert folyamaton keresztül, majd a déli blot eljárással membránra továbbítják., A membrán hibridizációja egy címkézett DNS-szondával ezután meghatározza a szondát kiegészítő fragmensek hosszát. A korlátozás fragmentum hossza polimorfizmus azt mondta, hogy akkor fordul elő, ha a hossza egy észlelt fragmentum változik egyének, jelezve nem azonos szekvencia homológiák. Minden fragmentum hossza allélnak tekinthető, függetlenül attól, hogy tartalmaz-e kódolási régiót vagy sem, és felhasználható a későbbi genetikai elemzésben.,

Sematikus RFLP által dekoltázs oldalon veszteség

Elemzés öröksége allélikus RFLP töredékek (NIH)

Sematikus RFLP által VNTR hossza változás

ExamplesEdit

két közös mechanizmus, amely által a méret egy adott restrikciós fragmentum eltérő lehet. Az első vázlatban a genom egy kis szegmensét DNS-szondával (vastagabb vonal) detektálják., Az a allélban a genomot három közeli helyen (háromszögekben) egy restrikciós enzim hasítja, de a szonda csak a jobb oldali fragmentumot fogja kimutatni. Az allél a-ban a 2. korlátozási helyet egy mutáció veszítette el, így a szonda most észleli a nagyobb olvasztott fragmentumot, amely az 1-3.helyekről fut. A második ábra azt mutatja, hogy ez a töredék méret variáció nézne ki egy Dél-blot, hogy minden allél (két egységenként) lehet, hogy örökölt egy család tagjai.,

a harmadik vázlatban a szonda és a restrikciós enzimet úgy választjuk ki, hogy a genom egy olyan régióját detektáljuk, amely változó számú tandem repeat (VNTR) szegmenst tartalmaz (dobozok sematikus diagramban). A C allélban öt ismétlés van a VNTR-ben, a szonda pedig egy hosszabb töredéket észlel a két korlátozási hely között. A D allélban csak két ismétlés van a VNTR-ben, így a szonda rövidebb töredéket észlel ugyanazon két korlátozási hely között. Más genetikai folyamatok, például betoldások, törlések, transzlokációk és inverziók szintén polimorfizmusokhoz vezethetnek., Az RFLP tesztek sokkal nagyobb DNS-mintákat igényelnek, mint a rövid tandem repeat (STR) tesztek.

Share

Vélemény, hozzászólás?

Az email címet nem tesszük közzé. A kötelező mezőket * karakterrel jelöltük