a napóleoni háborúk idején Európában az új világ spanyol gyarmatai elkezdték saját ügyeiket intézni., A növekvő autonómia végül a függetlenség felé való elmozdulást eredményezte, és a Río de la Plata, ma Argentína néven ismert Egyesült Tartományok a kék-fehér-kék vízszintes trikolór alatt hirdették szuverenitását. Ezt a felszabadítási zászlót Luís Aury privateer vitte a Karib-térségbe 1818-ban. Bár csak rövid ideig repült a Santa Catalina-szigetek felett Közép-Amerika partjainál, a zászló inspirálta a spanyol alanyokat azon a területen, akik szabadságukat keresik., Közép-Amerika függetlenségét először 1821.szeptember 15-én hirdették ki, majd két év Mexikói uralom után 1823-ban újra megerősítették. A Mexikói uralom elleni mozgalom vezetője Manuel José Arce El Salvadori ezredes volt. Kék-fehér-kék vízszintes csíkok zászlaja 1822.február 20-án áldást kapott San Salvador templomában, végül Közép-Amerika Egyesült tartományainak nemzeti zászlójává vált.
miután Közép-Amerika Egyesült Tartományai öt különböző országba betörtek, Salvador 1865-ig továbbra is használta zászlóját., Ezután több mint négy évtizede egy másik nemzeti zászlót használtak, amely hasonlított az Egyesült Államok csillagaira és Csíkjaira. 1912.szeptember 15-én azonban újra bevezették a kék-fehér-kék zászlót. Kisebb módosításokkal (Legutóbb 1972 szeptemberében) ma emlékeztet a közép-amerikai egységre. A zászló közepén lévő címer hasonlít az egykori közép-amerikai szövetség által használt címerre, és magában foglalja a “Dios, unión, libertad” (“Isten, Unió, szabadság”) nemzeti mottót. Lásd még Guatemala, Nicaragua, Costa Rica és Honduras zászlós történeteit.