Som var sant for de fleste upolare lipider, strukturer av polare lipider er basert på kondensering av fettsyrer med glyserol. Den viktigste forskjellen er at bare to av tre OH-grupper på glyserol er involvert. Den tredje er kombinert med en svært polar molekyl:
der X kan være en rekke funksjonelle grupper, for eksempel kolin, glyserol, ethanolamine, og serin, det eksempel vi har gitt. Dette gir en struktur der det er en svært polar hodet gruppe, med to lenger, ikke-polar fettsyrer kjede haler. Denne strukturen er ofte generalisert i en tegneserie-form også vist i Figur \(\PageIndex{1}\).
På en måte den polare lipider er som anioner av fettsyrer, bare enda mer. De inneholder to hydrofobe hydrokarbon haler og en leder som kan ha flere elektrisk ladet nettsteder., Som i tilfellet med såpe og vaskemiddel molekyler, haler av polare lipider har en tendens til å unngå vann og andre polare stoffer, men hodet er helt kompatibel med slike miljøer.
Den polare lipider finnes oftest som komponenter i cellen vegger og andre slimhinner. Nesten alle hypoteser om membran struktur ta som en fundamental komponent en lipid bilayer (Figur \(\PageIndex{2}\) )., Bilayers laget i laboratoriet har mange egenskaper til felles med membraner. Ioner som Na+, K+ og Cl– ikke kan passere gjennom dem, men vannmolekyler kan. Hydrokarbon kjernen i en slik bilayer bør ha stor elektrisk motstand, som gjør en membran. Enkelte transportør molekyler som kan transportere K+ og andre ioner over en bilayer, tilsynelatende ved å pakke et hydrofobt kappe rundt dem for å skjule sine kostnader. Membranproteiner i en bilayer også tillate for transport av ioner og andre molekyler over bilayer som ikke kunne krysse på annen måte.