Mot slutten av Joseph ‘ s regjeringstid, det var faktisk økende misnøye. Religiøse elementer var misfornøyd med mange av sine reformer, og både herrer og bønder var engstelig om hva hans landbruket endringene vil bety for deres fremtid. Dessuten noen andre regler som hadde inspirert motstand., I 1784 han informerte den ungarske regjering som sitt offisielle språk, Latin, var ikke effektiv for moderne regjeringen og, siden ungarske ble uttalt av bare en del av befolkningen i det rike, at språket av regjeringen fra da av ville være tysk. At språket ville bli brukt i den sentrale kontorer umiddelbart, i fylket kontorer etter ett år, og i den lokale kontorer etter tre. Regjeringen sysselsetting og selv medlemskap i den ungarske Diett ville være åpne for å tyske høyttalere., Selv om det ble designet for å forenkle administrasjon, mange Ungarere tolket dette språket herskende å være en trussel mot hele deres kultur og snakket ut entusiastisk mot det. For å legge til Ungarerne’ skrekk, Josef nektet å sende til en kroning i Ungarn at han har til å sverge på å opprettholde lover at han ikke ønsker å, og da han hadde den hellige kronen av rike flyttet til Wien.
Ved 1787 motstand mot Josef og hans regjering ble forverret seg., En Habsburg besittelse som hadde rømt reformer under regimet til Maria Theresa og Josef var den Østerrikske Nederland, som styrte seg under sine egne lover. I januar og Mars 1787 Joseph bare feid bort grunnloven av den Østerrikske Nederland og annonsert at fra da av ville bli styrt i henhold til absolutistiske prinsipper, akkurat som de andre provinsene av monarkiet. Motstand simmered i den Østerrikske Nederland til 1789, da det kokte over i åpent opprør, å tvinge administrasjon det å flykte til sikkerhet i hertugdømmet av Luxembourg., Innen den tid det var også rykter om opprør i Ungarn og i Galicia, og for en periode virket det som om revolusjonen kan bryte ut i mange deler av monarkiet.
Joseph ‘ s reformer kanskje ikke har generert så mye motstand hadde det ikke vært for hans utenrikspolitikk. Josef var ikke spesielt aggressiv i foreign affairs, men han gjorde følg anti-Franske råd for hans og hans mors gamle kansler, Kaunitz, og at råd endte i ulykke. Kaunitz fast overbevist om at Østerrike kunne sjekke Preussen bare med hjelp fra Russland., Følgelig, i 1781 han og Joseph forhandlet med Katarina den Store, en pakt som er fastsatt for russisk hjelp for Østerrike i tilfelle av krig med Preussen. I exchange, Østerrike lovet å hjelpe Russland i tilfelle av krig med det Osmanske Riket. Trygg på sin diplomatiske og militære styrke, Catherine så engasjert i en serie av provokasjoner mot Tyrkerne som resulterte i 1787 i en erklæring av krig av sultan. Selv om Josef hadde ikke noe reelt ønske om å delta i denne krigen, hans folkerettslige forpliktelser med Russland pålagt ham å gjøre det. Ved første krigen gikk dårlig., I 1788 var Østerrikerne ventet for Russerne å ta offensiven i rumensk land, som de ikke klarte å gjøre—bare for å være seg selv angrepet av Tyrkerne og sendt scurrying nord fra Donau i et forsøk på å reconsolidate sine linjer. Joseph var selv til stede på denne kampanjen, som gjorde ingen noe godt. Han kunne ikke inspirere sine ledere til å være mer aggressive, og han ble ganske syk, så mye at han kom tilbake til Wien i slutten 1788 i et forsøk på å gjenopprette., Kampanjen i 1789 gikk mye bedre, noe som resulterer i den Østerrikske erobringen av den viktige festningen i Beograd ved sammenløpet av Sava og Donau elver og i en felles Østerriksk-russiske offensiven i Moldova og Walachia som kjørte Tyrkerne hele veien til Donau.
Men denne gangen alle de uheldige konsekvensene av Joseph ‘ s innenriks-og utenrikspolitikk var bærer ned på ham. Selve krigen forårsaket en utgytelse av populære agitasjon mot hans utenrikspolitikk, folk av den Østerrikske Nederland rose i direkte revolusjon, og rapporter om problemer i Galicia økt., Til slutt var det Ungarn som brøt Joseph ‘ s ånd. I 1788 hadde han til convoke den gamle county forsamlinger til å be for rekrutter og utstyr for å kjempe i krigen. De adelsmennene som gjorde opp disse forsamlingene svarte med protester og krav om at den gamle grunnloven gjenopprettes og at Joseph sende til kroningen i den tradisjonelle ungarske måte. Selv den ungarske kansellisjef departementet i den sentrale regjeringen i kostnad av ungarsk saker, anbefales at Joseph gi til disse ønskene sine bestanddeler.,
Møtt med disse vanskelighetene, Joseph opphevet mange av de reformene som han hadde vedtatt tidligere. I et brev av januar 1790 han understreket hans gode intensjoner i å vedta sin nye lover i Ungarn og deretter trukket tilbake alle av dem, bortsett fra Kunngjøring av Toleranse, lover knyttet til status for bøndene, og den monastiske reformer. Han enige om å kalle den ungarske Kosthold—men ikke for tidlig, gitt den farlige situasjon internasjonalt, og han har samtykket til å gå tilbake kronen til Ungarn og sin egen kroning som landets konge., Kronen aldri skjedde, men for Joseph døde den følgende måneden.