Bidartondo verhuisde naar Kew in juli 2004 na zijn onderzoek aan UC Berkeley. Daar brengt hij het grootste deel van zijn tijd door, hoewel hij een gezamenlijke afspraak heeft met Imperial College London, die bedoeld is om een onderzoekspartnerschap op het gebied van biodiversiteit tussen de twee instellingen op gang te brengen., Bij Imperial geeft Bidartondo postdoctorale lezingen over schimmels, ecologie en behoud, terwijl hij bij Kew onderzoek doet met betrekking tot zijn afstudeerwerk, waarbij hij de coevolutie van planten en schimmels bestudeert. Bidartondo is blij met de situatie, zegt hij, want “ik ervaar twee omgevingen met zeer verschillende manieren van werken.,”
Zeldzaam ras
Mycologists zoals Bidartondo zijn een zeldzaam ras, en de vraag voor schimmels wetenschappers is relatief klein. Tegelijkertijd lijkt er een tekort aan gekwalificeerde mensen te zijn om die paar mycologische banen te vullen. Maar met doorzettingsvermogen en een liefde voor schimmels, kunnen mycologen werk vinden op vele gebieden, van academisch onderzoek tot toegepaste landbouw.,
Kew ‘ s missie in de mycologie is het vergroten van de kennis over schimmels door het identificeren en beschrijven van nieuwe families, geslachten en soorten in het Verenigd Koninkrijk en overzee. Dat is een hele opgave voor zo ’n kleine afdeling, stelt Brian Spooner, hoofd van Kew’ s mycologie-afdeling. Met uitzondering van Bidartondo, die voornamelijk in de moleculaire ecologie werkt, heeft Kew drie stafmycologen die zich toeleggen op het identificeren van nieuwe soorten en het verzorgen van de schimmel collectie in Kew ‘ s herbarium. Dit is” nauwelijks genoeg om lening aanvragen en curatie te houden, ” Spooner zegt., naast de taxonomische doelstellingen bieden de mycologen van Kew deskundig advies en bijstand aan overheden en het grote publiek over praktische aspecten van mycologie, van vergiftigingen tot advies over houtrot schimmels. “We kregen bijvoorbeeld een verzoek om informatie van de politie in een vermoedelijke vergiftigingszaak die mogelijk Amanita veroorzaakte”, zegt Heidi Döring, laboratoriummanager en taxonomisch mycoloog bij Kew. “We krijgen ook vragen van huisdiereigenaren of dierenartsen over schimmels die door honden zijn opgegeten.,”
mycologen met een opleiding en interesse in taxonomie zijn de laatste jaren moeilijk te vinden. Kew slaagde er niet in om geadverteerde posities in grassystematiek en mycologie te vullen door een gebrek aan kandidaten met geschikte ervaring, zegt Spooner. De klassieke taxonomie, die morfologische kenmerken gebruikt om soorten te identificeren, wordt vervangen door DNA-barcodeertechnieken die genen gebruiken om eerder bekende soorten uit elkaar te houden. Maar alleen naar genen kijken helpt niet bij het ontdekken van nieuwe schimmelsoorten.,
klassieke mycologen hebben formeel ongeveer 70.000 soorten schimmels beschreven, maar” er wordt geschat dat er alleen al op planten minstens 1,5 miljoen soorten voorkomen”, zegt Pedro Crous, voorzitter van de International Mycological Association. Als andere niches, zoals de bodem, in detail werden onderzocht, zouden er miljoenen meer soorten worden gevonden, voegt hij eraan toe. Gezien de farmaceutische en voedingswaarde van de groep, als er geen nieuwe schimmels worden beschreven, “wie weet wat we missen?”Vraagt Spooner.,
Schimmels carrière
Omdat dat de farmaceutische en voedingswaarde, “met een opleiding in mycologie, bent u in staat om te werk in diverse sectoren van de samenleving buiten de academische wereld,” zegt Crous., “Paddenstoelen hebben veel potentieel voor geneesmiddelen tegen kanker of bioremediatie van door vervuiling geteisterde gebieden,” zegt mycoloog John Collier, 34, research and development manager bij Monaghan Mushrooms, een verse champignonproducent in Ierland. net als Bidartondo raakte Collier al op jonge leeftijd geïnteresseerd in schimmels, waarbij hij paddenstoelen plukte in de velden rond zijn ouderlijk huis in Ierland. Hij studeerde plantkunde aan het University College Dublin in Ierland en volgde zo veel mogelijk cursussen in mycologie., Terwijl op de universiteit, Collier las een boek genaamd moord, magie, en geneeskunde over het gebruik van chemicaliën uit planten en schimmels in vergiften, medicijnen, en drugs. Het boek ” inspireerde me om meer te leren over de verbindingen die planten en schimmels produceren om zichzelf te beschermen tegen ongedierte en concurrenten en om hun kansen op bevruchting en verspreiding te vergroten,” zegt hij. zijn interesse in medische toepassingen van planten leidde hem naar een Ph. D. in Dublin, waar hij onderzoek deed naar de productie van geneesmiddelen in plantencelculturen., Na een paar jaar in het patenteren en commercialiseren van wetenschappelijk onderzoek te hebben gewerkt, ging Collier terug naar de academische wereld voor een postdoc, waar hij het gebruik van geneeskrachtige schimmelextracten in zuiveldranken bestudeerde. In oktober 2007 sloot Collier zich aan bij Monaghan Mushrooms om een onderzoeks-en ontwikkelingsafdeling op te richten binnen het bedrijf. Het doel: het verbeteren van de kerntechnologieën van het bedrijf en het diversifiëren van zijn activiteiten door het onderzoeken van nieuwe gebieden van de champignoneconomie.
Collier leidt zes wetenschappers in twee teams. Een team werkt aan het verbeteren van de opbrengst van paddenstoelen en de kwaliteit van paddenstoel compost., Het tweede team werkt aan “een reeks projecten”, zegt hij, waarbij champignonafval wordt toegepast op nieuwe gebieden zoals hernieuwbare energie en de chemische industrie. Als onderzoeksgezicht van het bedrijf werkt Collier samen met universitaire wetenschappers en neemt hij deel aan wetenschappelijke conferenties over schimmels en hun potentiële economische effecten. “Het is een zeer gevarieerde rol, en ik doe nooit hetzelfde 2 dagen op een rij,” zegt hij.,
industrieel onderzoek gewijd aan mycologie is nog steeds zeldzaam, maar Collier gelooft dat andere bedrijven het voorbeeld van Monaghan zullen volgen omdat de potentiële economische voordelen van wetenschappelijke Investeringen groot zijn. Ook ,” het genoom van schimmels is nog steeds zeer onbekend, en naarmate er meer onderzoek wordt gedaan op dit gebied, zullen we een beter begrip krijgen van schimmels genen en hoe ze kunnen worden gemanipuleerd,” voegt hij toe.
omdat schimmels een grote rol spelen in de landbouw, kunnen mycologen een baan vinden als plantpathologen, quarantainemedewerkers en inspecteurs of paddenstoelentelers., “Er zijn tal van opties voor mycologen op dit gebied, en hetzelfde kan worden gezegd voor de gezondheidssector of toegepaste gebieden waar schimmels problemen veroorzaken en bederven in producten of de kwaliteit van leven te verminderen,” Crous voegt toe., “het mycologieonderwijs heeft zijn traditionele thuis in veel botanische afdelingen verloren”, zegt Paul Szaniszlo, een professor in moleculaire genetica en microbiologie aan de Universiteit van Texas, Austin, en voegt eraan toe dat hij niet op de hoogte is van enige mycologie-specifieke programma ‘ s in de Verenigde Staten, maar dat schimmel-wetenschappen nu vaak worden onderwezen als modules binnen plantkunde en microbiologie graden., Door het gebrek aan formele opleidingsmogelijkheden verwachten toezichthouders niet dat toekomstige studenten een grondige kennis van mycologie hebben; in plaats daarvan zoeken ze interesse in schimmels en een achtergrond in plantenwetenschappen, microbiologie of bio-informatica.
zoals Bidartondo en Collier aantonen, betekent de opleiding tot mycoloog meestal dat de specialisatie ten minste tot de graduate school wordt uitgesteld. “Er is geen B.Sc. degree cursus in mycologie in het Verenigd Koninkrijk,” zegt Gareth Griffith van Aberystwyth University in het Verenigd Koninkrijk, hoewel sommige afdelingen bieden undergraduate cursussen over het onderwerp., Het type mycologie dat wordt onderwezen varieert tussen universiteiten: Aberystwyth bijvoorbeeld heeft ” een sterkere kijk op schimmelecologie en plantenpathologie, terwijl universiteiten met een sterk Medische Microbiologie B.Sc. regeling zou de neiging om zich te concentreren op pathogene schimmels,” Griffith voegt. Op masterniveau biedt University College London een opleiding in medische mycologie.
het type mycologie dat op postdoctoraal niveau wordt onderwezen, hangt voornamelijk af van de belangen van de hoofdonderzoeker en de strategische visie van de afdeling., Bijvoorbeeld, zowel de Zweedse universiteit voor landbouw in Uppsala en Matteo Garbelotto ‘ s lab op UC Berkeley hebben momenteel openingen in bos mycologie, die zich richt op schimmelziekten van bomen zoals plotselinge eiken dood. In het Verenigd Koninkrijk “is de Universiteit van Exeter momenteel een broeinest van onderzoeksactiviteiten naar schimmels als ziekteverwekkers van planten, terwijl Aberdeen een breed scala aan mycologische interesses heeft, waaronder dierlijke pathogenen en mycorrhizale schimmels”, zegt Lynne Boddy, president van de British Mycological Society.,ondanks de huidige schaarste aan mycologen is Collier optimistisch over de toekomst van het veld. Nieuwe zakelijke kansen gecreëerd door de champignonindustrie, hernieuwbare energie, ecologische sanering, en, in het bijzonder, de farmaceutische industrie zijn gebonden aan “het genereren van interesse in mycologie en, op zijn beurt, het creëren van nieuwe banen,” zegt hij.
geselecteerde mycologische laboratoria
De mycologiespecialiteit van een universiteit hangt grotendeels af van de belangen van de hoofdonderzoeker en de strategische visie van de afdeling.,>- Myco Site van de Universiteit van Oslo, Noorwegen
– resund Mycologie School, Denemarken
Elders
– Moleculaire Mycology Research Laboratory van de Universiteit van Sydney, Australia
– Mycologie Lab, Venezuela
– De Bosbouw, Biotechnologie in de Landbouw Instituut, Zuid-Afrika
Algemene informatie
– De WWW Virtual Library: Mycologie, bevat de map van mycologists en mycologische labs
– Mycologists Online, world-wide directory voor mycologie en lichenology
Foto (boven): Jon Mitchell
Sara Coelho is een voormalig Science news stagiaire.,