“hoewel we ten prooi zijn aan een klein aantal eerlijk pathogene micro-organismen, zijn we gastheer voor talloze commensale bacteriën, schimmels, protozoa’ s en minuscule insectensoorten. Voor de meeste commensale bacteriële species, is hun replicatie op of in ons essentieel voor hun overleving. Bovendien is onze eigen overleving waarschijnlijk afhankelijk van de aanwezigheid van die micro-organismen. S. Falkow. 1997. ASM News 63: 359-365.,
acquisitie van de normale lichaamsflora
vóór de geboorte zijn de meeste mensen microbiologisch in wezen steriel. Er zijn virussen en bacteriën die de placentabarrière kunnen passeren, maar deze voorvallen zijn zeldzaam. Onze eerste blootstelling aan grote aantallen micro-organismen wordt veroorzaakt door onze korte trip langs het geboortekanaal, hoewel deze blootstelling een beetje vertraagd is voor de bijna 30% van de baby ‘ s die nu geboren worden door een keizersnede., Deze eerste blootstelling aan de rijke microbiële populatie van het geboortekanaal van de moeder veroorzaakt zelden problemen, hoewel het wel resulteert in de inoculatie van de pasgeboren huid, nasofarynx en darm met een verscheidenheid aan micro-organismen, die niet allemaal blijven bestaan in de weefsels van de baby. Handling, knuffelen, reinigen en verpleging dragen meer vertegenwoordigers bij aan de cast van microbiële soorten die een foot-hold krijgen (biofilm hold?) in denieuw-borne.,
het dieet van de new borne speelt een beslissende rol in de microbiële populatie van de darm, waarbij de flora van zuigelingen die borstvoeding krijgen wordt gedomineerd door organismen zoals Bifidobacteriumbifidus. Overgang naar koemelk of melkgebaseerde formule stimuleert de groei van gasproductie colibacteriën, een overgang die vaak door ouders wordt opgemerkt als een reukverandering wanneer luierverandering noodzakelijk is., Voortdurende veranderingen in de voeding vinden plaats naarmate het dieet steeds complexer wordt en uiteindelijk de kenmerken van de volwassen darm aanneemt met een overwicht van organismen als Bacteroides spp, Fusobacterium spp, anaërobe cocci, enterokokken, gisten en protozoa.
een soortgelijke ecologische opvolging vindt plaats in vrijwel elk gekoloniseerd gebied van het lichaam, hoewel de mate van verandering en de specifieke microbiële vertegenwoordigers sterk verschillen van het ene orgaansysteem tot het andere.,
in de mond bijvoorbeeld valt het eerste voorkomen van tanden samen met het voorkomen van vele soorten streptokokken, waaronder S. sanguis. Dit organisme wordt een belangrijk onderdeel van de Volwassen Orale flora.Maar S. sanguis wordt vergezeld door een groot aantal andere bewoners, die zich met elkaar samenvoegen in een reeks van prachtig precieze paren die leiden tot een ecologische opvolging die in vele opzichten de opeenvolging van planten in een pas ontruimd bosgebied nabootst., In een van de meest grondige onderzoeken van orale micro-organismen, Paul Kolenbrander heeft geïdentificeerd maar liefst 600 verschillende soorten die worden gevonden in de mond (referentie nodig).