devido à natureza complementar do emparelhamento de bases entre polímeros de ácido nucleico, uma molécula de ADN de cadeia dupla será composta por duas cadeias com sequências que são complementares inversos uma da outra. Para ajudar os biólogos moleculares a identificar cada cadeia individualmente, as duas cadeias são geralmente diferenciadas como a cadeia” sentido “e a cadeia” anti-senso”., Um indivíduo fita de DNA é referido como positivo o sentido (também positivo (+) ou simplesmente sentido) se a sua sequência ou a sequência parcial corresponde diretamente para a sequência do RNA, transcrição, que é traduzido ou convertido em uma seqüência de aminoácidos (desde que qualquer timina bases na sequência de DNA são substituídos com uracilo bases na sequência de ARN). A outra cadeia da molécula de DNA de cadeia dupla é referida como sentido negativo (também negativo (-) ou antisense), e é reversa complementar tanto a cadeia de sentido positivo e a transcrição de RNA., Ele é, na verdade, o antisense vertente que é usado como modelo a partir do qual o RNA polimerases construir o RNA, a transcrição, mas complementares da base de dados de emparelhamento pelo qual o ácido nucleico de polimerização ocorre significa que a sequência do transcrito de RNA ficará idêntico ao sentido strand, além do transcrito de RNA do uso de uracilo em vez de timina.
por vezes, as frases que codificam a cadeia e a cadeia de template são encontradas no lugar do sentido e antisense, respectivamente, e no contexto de uma molécula de DNA de cadeia dupla o uso destes Termos é essencialmente equivalente., No entanto, a cadeia de codificação/sentido nem sempre precisa conter um código que é usado para fazer uma proteína; tanto a codificação de proteínas como as RNAs não codificantes podem ser transcritas.
os Termos “sentido” e “anti-senso” são relativos apenas à transcrição particular de RNA em questão, e não à cadeia de DNA como um todo. Em outras palavras, ou cadeia de DNA pode servir como o sentido ou Cadeia antissense. A maioria dos organismos com genomas suficientemente grandes fazem uso de ambas as cadeias, com cada cadeia funcionando como a cadeia modelo para diferentes transcrições de RNA em lugares diferentes ao longo da mesma molécula de DNA., Em alguns casos, transcrições de RNA podem ser transcritas em ambos os sentidos (ou seja, em ambos os lados) a partir de uma região promotora comum, ou ser transcritos a partir de dentro de intrões em ambos os lados (ver “ambisense” abaixo).
Antisense DNAEdit
O DNA sentido vertente parece que o RNA mensageiro (mRNA) de transcrição, e, portanto, pode ser usado para ler o esperado codão sequência que será utilizada durante a tradução (síntese de proteínas) para criar uma sequência de aminoácidos e, em seguida, uma proteína., Por exemplo, a sequência “ATG” dentro de uma cadeia de Sentido DNA corresponde a um codão “AUG” no ARNm, que codifica para o aminoácido metionina. No entanto, o DNA sentido strand em si não é usado como modelo para o mRNA; é o DNA antisense vertente que serve como fonte para o código da proteína, porque, com bases complementares ao DNA sentido strand, ele é usado como um modelo para o mRNA. Uma vez que a transcrição resulta em um produto de RNA complementar à cadeia de template de DNA, o ARNm é complementar à cadeia de antissenso de DNA.,
Esquemático mostrando como antisense cadeias do ADN pode interferir com proteína de tradução
Portanto, base de um trio de 3′-TAC-5′ do DNA antisense strand (complementares para o 5′-ATG-3′ do DNA sentido strand) é usado como modelo o que resulta em uma 5′-AUG-3′ da base de dados de trio no mRNA. A cadeia DNA sense terá o tripleto ATG, que parece semelhante ao mRNA triplet AUG, mas não será usado para fazer metionina, porque não será usado diretamente para fazer mRNA., A cadeia de sentido do DNA é chamada de cadeia “sentido” não porque ela será usada para fazer proteína (não será), mas porque ela tem uma sequência que corresponde diretamente à sequência de codon RNA. Por esta lógica, a transcrição de RNA em si é por vezes descrita como “sentido”.,
Exemplo com um double-stranded DNAEdit
DNA 1: antisense strand (transcrito a) → RNA strand (sentido) DNA 2: sentido vertente
Algumas regiões dentro de um double-stranded molécula de DNA, o código para os genes, que são geralmente instruções especificar a ordem em que os aminoácidos são montados para fazer proteínas, bem como regulamentar as sequências, de emenda de sites não-codificantes de íntrons, e outros produtos de gene. Para uma célula usar esta informação, uma cadeia do DNA serve como um modelo para a síntese de uma cadeia complementar de RNA., A cadeia de DNA transcrita é chamada de cadeia template, com sequência antissense, e a transcrição mRNA produzida a partir dela é dita ser sequência de sentido (o complemento do antissense). A cadeia de DNA não-transcrita, complementar à cadeia transcrita, também é dita ter seqüência de sentido; ela tem a mesma seqüência de sentido que a transcrição de mRNA (embora bases T no DNA são substituídas por bases U no RNA).
| 3’CGCTATAGCGTTT 5′ | DNA antisense strand (modelo/noncoding) | é Utilizado como molde para a transcrição., |
| 5′GCGATATCGCAAA 3′ | DNA sense strand (nontemplate/coding) | Complementary to the template strand. |
| 5′GCGAUAUCGCAAA 3′ | mRNA sense transcript | RNA strand that is transcribed from the noncoding (template/antisense) strand. Note1: Except for the fact that all thymines are now uracils (T → U), it is complementary to the noncoding (template/antisense) DNA strand and identical to the coding (nontemplate/sense) DNA strand., |
| 3’CUAUAGCGUUUU 5′ | mRNA antisense transcript | Rna strand that is transcribed from the coding (nontemplate / sense) strand. Nota: exceto pelo fato de que todas as timinas são agora uracils (T → U), é complementar à cadeia de DNA coding (não emplate/sense) e idêntica à cadeia de DNA não coding (template/antisense)., |
Os nomes atribuídos para cada vertente, na verdade, dependem de qual direção você está escrevendo a sequência que contém as informações para proteínas (o “sentido” de informações), não em que vertente é retratado como “em cima” ou “em baixo” (que é arbitrária)., A única informação biológica que é importante para as cadeias de etiquetagem são as localizações relativas do grupo fosfato 5 terminal e do grupo hidroxilo 3 terminal (no final da cadeia ou sequência em questão), porque estas terminações determinam a direção de transcrição e tradução. Uma sequência escrita em 5 ‘- CGCTAT-3 ‘é equivalente a uma sequência escrita em 3′-TATCGC-5′ enquanto se observarem as extremidades 5′ e 3′. Se os fins não são rotulados, a convenção é assumir que ambas as sequências são escritas na direção de 5′-a-3’., O “Watson strand” refere-se a 5′-a-3′ Top strand (5’→3′), enquanto o “Crick strand” refere-se a 5′ – a-3′ bottom strand (3’←5′). Ambos os cordões Watson e Crick podem ser fios sensoriais ou antissensivos, dependendo do produto genético específico feito a partir deles.,
Por exemplo, a notação “YEL021W”, um alias do gene URA3 usado no National Center for Biotechnology Information (NCBI) de banco de dados, indica que este gene é no dia 21 de quadros de leitura aberta (ORF) do centrômero do braço esquerdo (L) de Fermento (Y) o número de cromossomos V (E), e que a expressão de codificação strand é o Watson strand (W). “YKL074C” significa o 74º ORF à esquerda do centrômero do cromossomo XI e que a cadeia de codificação é a cadeia Crick (C). Outro termo confuso referente a” Plus “e” Minus ” strand também é amplamente utilizado., Se a cadeia é sense (positivo) ou antisense (negativo), a sequência de consulta padrão no alinhamento de explosão NCBI é “Plus” strand.