datorită naturii complementare a împerecherii de bază între polimerii acidului nucleic, o moleculă de ADN dublu catenar va fi compusă din două fire cu secvențe care sunt complemente inverse între ele. Pentru a ajuta biologii moleculari să identifice în mod specific fiecare fir individual, cele două fire sunt de obicei diferențiate ca firul „sens” și firul „antisens”., Un individ fir de ADN este menționată ca sens pozitiv (de asemenea, pozitiv (+) sau pur și simplu sens) dacă secvența de nucleotide corespunde direct la secvența de ARN transcript care este tradus sau traductibile într-o secvență de aminoacizi (cu condiția ca orice timină baze în secvența ADN-ului sunt înlocuită cu uracil baze în secvența ARN). Celălalt fir al moleculei ADN dublu catenar este denumit negativ (de asemenea negativ (-) sau antisens) și este complementar invers atât cu firul pozitiv, cât și cu transcrierea ARN., Acesta este, de fapt strand antisens care este folosit ca șablon din care ARN polimerazele construct ARN transcript, dar complementare bază asocierea prin care acidul nucleic de polimerizare se produce înseamnă că secvența de ARN transcript va arata identic cu sensul strand, în afară de ARN transcript utilizarea de uracil în loc de timină.
Uneori fraze codificator și șablon strand sunt întâlnite în loc de sens și antisens, respectiv, și în contextul de o moleculă de ADN dublu catenar de utilizare a acestor termeni este, în esență echivalente., Cu toate acestea, componenta de codificare/sens nu trebuie să conțină întotdeauna un cod care este utilizat pentru a face o proteină; atât ARN-urile care codifică proteinele, cât și cele care nu codifică pot fi transcrise.
termenii „sens” și” antisens ” sunt relative numai la transcrierea ARN în cauză și nu la firul ADN în ansamblu. Cu alte cuvinte, fie componenta ADN poate servi ca sens sau antisens strand. Majoritatea organismelor cu genomuri suficient de mari folosesc ambele catene, fiecare catenă funcționând ca catenă șablon pentru transcrieri ARN diferite în locuri diferite de-a lungul aceleiași molecule de ADN., În unele cazuri, transcrierile ARN pot fi transcrise în ambele direcții (adică pe fiecare fir) dintr-o regiune promotor comună sau pot fi transcrise din interiorul intronilor pe oricare dintre fire (vezi „ambisense” de mai jos).
Antisens DNAEdit
ADN-ul sens strand se pare ca ARN mesager (arnm) transcriere, și, prin urmare, poate fi folosit pentru a citi temperatura secventa codon care va fi în cele din urmă folosit în traducere (sinteza de proteine) pentru a construi o secvență de aminoacizi, și apoi o proteină., De exemplu, secvența „ATG” dintr-un fir de sens ADN corespunde unui codon „AUG” din ARNm, care codifică aminoacidul metionină. Cu toate acestea, Catena sens ADN în sine nu este folosit ca șablon pentru ARNm; este Catena antisens ADN care servește ca sursă pentru codul de proteine, deoarece, cu baze complementare la catena sens ADN, este folosit ca un șablon pentru ARNm. Deoarece transcripția are ca rezultat un produs ARN complementar cu catena șablonului ADN, ARNm este complementar cu catena antisens ADN.,
Schematice care arată cum antisens ADN-ului poate interfera cu proteine de traducere
prin Urmare, o bază de triplet 3′-TAC-5′ în ADN antisens strand (complementare 5′-ATG-3′ a ADN-ului sens strand) este folosit ca șablon care rezultă într-un 5′-AUG-3′ baza triplet în arnm. Firul de sens ADN va avea tripletul ATG, care arată similar cu tripletul mRNA AUG, dar nu va fi utilizat pentru a face metionină, deoarece nu va fi utilizat direct pentru a face ARNm., Componenta sens ADN este numită” sens ” nu pentru că va fi folosită pentru a face proteine (nu va fi), ci pentru că are o secvență care corespunde direct secvenței de codoni ARN. Prin această logică, transcrierea ARN în sine este uneori descrisă ca „sens”.,
de Exemplu, cu dublu catenar DNAEdit
ADN 1: strand antisens (transcris la) → ARN strand (sens) ADN 2: sens strand
Unele regiuni dintr-o moleculă de ADN dublu catenar cod pentru gene, care sunt, de obicei, instrucțiuni care specifică ordinea în care aminoacizii sunt asamblate pentru a face proteine, precum și de reglementare secvențe, despicare site-uri, non-codare introni, și alte produse de gene. Pentru ca o celulă să utilizeze aceste informații, o catenă a ADN-ului servește ca șablon pentru sinteza unei catene complementare de ARN., Catena ADN transcrisă este numită Catena șablon, cu secvență antisens, iar transcrierea ARNm produsă din ea se spune că este secvența de sens (complementul antisensului). Catena ADN netranscrisă, complementară cu catena transcrisă, se spune, de asemenea, că are secvență de sens; are aceeași secvență de sens ca transcrierea ARNm (deși bazele T din ADN sunt substituite cu bazele U din ARN).
| 3’CGCTATAGCGTTT 5′ | ADN antisens strand (șablon/noncoding) | Folosit ca un șablon pentru transcriere., |
| 5′GCGATATCGCAAA 3′ | DNA sense strand (nontemplate/coding) | Complementary to the template strand. |
| 5′GCGAUAUCGCAAA 3′ | mRNA sense transcript | RNA strand that is transcribed from the noncoding (template/antisense) strand. Note1: Except for the fact that all thymines are now uracils (T → U), it is complementary to the noncoding (template/antisense) DNA strand and identical to the coding (nontemplate/sense) DNA strand., |
| 3’CGCUAUAGCGUUU 5′ | arnm antisens transcriere | ARN fir care este transcris de codificare (nontemplate/sens) strand. Notă: cu Excepția faptului că toate thymines sunt acum uracils (T → U), este complementară de codificare (nontemplate/sens) ADN și sunt identice cu cele noncoding (șablon/antisens) ADN-ului., |
numele atribuit fiecărui fir de fapt depinde de direcția în care scrieți secvența care conține informații pentru proteine („sens” informații), nu pe ce fir este descris ca „pe sus” sau „jos” (care este arbitrară)., Singurele informații biologice care sunt importante pentru etichetarea toroanelor sunt locațiile relative ale grupării fosfatice terminale 5′ și ale grupării hidroxil terminale 3′ (la capetele firului sau secvenței în cauză), deoarece aceste capete determină direcția transcrierii și traducerii. O secvență scrisă 5′ – CGCTAT-3 ‘este echivalentă cu o secvență scrisă 3′ – TATCGC-5′ atâta timp cât se notează capetele 5′ și 3′. Dacă capetele nu sunt etichetate, Convenția presupune că ambele secvențe sunt scrise în direcția 5′-to-3’., La „Watson strand” se referă la 5’la 3′ catena de sus (5’→3′), întrucât „Crick strand” se referă la 5’la 3′ catena de jos (3’←5′). Atât șuvițele Watson, cât și Crick pot fi fire de sens sau antisens, în funcție de produsul genetic specific obținut din ele.,
De exemplu, notația „YEL021W”, un alias al URA3 gene utilizate în National Center for Biotechnology Information (NCBI), baza de date denotă faptul că această genă este în a 21-a deschis cadrul de citire (ORF) de la centromer de brațul stâng (L) de Drojdie (Y) cromozom numărul V (E), și că expresia codificator este Watson strand (W). „YKL074C” denotă cel de-al 74-lea ORF din stânga centromerului cromozomului XI și că firul de codificare este firul Crick (C). Un alt termen confuz care se referă la” plus ” și „Minus” strand este, de asemenea, utilizat pe scară largă., Indiferent dacă firul este sens (pozitiv) sau antisens (negativ), secvența de interogare implicită în alinierea exploziei NCBI este „plus”.