Spre sfârșitul lui Iosif domniei lui, a existat într-adevăr o nemulțumire crescândă. Elementele religioase erau nemulțumite de multe dintre reformele sale și atât domnii, cât și țăranii erau îngrijorați de ceea ce ar însemna schimbările sale agricole pentru viitorul lor. Mai mult, alte câteva politici au inspirat rezistență., În 1784 el a informat guvernul maghiar că limba oficială, latina, nu era eficientă pentru guvernarea modernă și, din moment ce limba maghiară era vorbită doar de o parte din populația acelui regat, că limba de guvernare de atunci va fi germana. Această limbă va fi folosită imediat în birourile centrale, în birourile județene după un an și în birourile locale după trei. Angajarea Guvernului și chiar aderarea la dieta maghiară ar fi deschise doar vorbitorilor de limbă germană., Deși a fost conceput pentru a facilita administrarea, mulți maghiari au interpretat această guvernare lingvistică ca fiind o amenințare pentru întreaga lor cultură și au vorbit cu entuziasm împotriva ei. Pentru a adăuga oroarea maghiarilor, Iosif a refuzat să se supună unei încoronări în Ungaria ca nu cumva să jure că va respecta legi pe care nu le-a dorit, iar apoi a mutat coroana sacră a Regatului la Viena.până în 1787 rezistența față de Iosif și guvernul său se intensifica., O posesiune Habsburgică care a scăpat de reforme în timpul domniei Mariei Tereza și a lui Iosif a fost Olanda austriacă, care s-a guvernat după propriile legi. În ianuarie și martie 1787 Iosif pur și simplu a măturat Constituția Olandei austriece și a anunțat că de atunci va fi condusă după principii absolutiste, la fel ca și celelalte provincii ale monarhiei. Rezistența a clocotit în țările de Jos austriece până în 1789, când a fiert într-o revoltă deschisă, forțând administrația de acolo să fugă în siguranță în Ducatul Luxemburgului., În acel moment au existat, de asemenea, zvonuri de rebeliune în Ungaria și în Galicia, și pentru o perioadă a apărut ca și cum Revoluția ar putea izbucni în multe părți ale monarhiei.reformele lui Iosif s-ar putea să nu fi generat la fel de multă opoziție dacă nu ar fi fost pentru politica sa externă. Joseph nu a fost deosebit de agresiv în afacerile externe, dar a urmat sfatul anti-prusac al fostului cancelar al său și al mamei sale, Kaunitz, iar acest sfat s-a încheiat cu nenorocire. Kaunitz credea cu tărie că Austria ar putea verifica Prusia doar cu ajutorul Rusiei., În consecință, în 1781, el și Iosif au negociat cu Ecaterina cel Mare un pact care prevedea ajutor rusesc pentru Austria în caz de război cu Prusia. În schimb, Austria a promis să ajute Rusia în caz de război cu Imperiul Otoman. Încrezătoare în puterea ei diplomatică și militară, Catherine s-a angajat apoi într-o serie de provocări față de turci, care au dus în 1787 la o declarație de război a sultanului. Deși Iosif nu a avut nici o dorință reală de a participa la acest război, obligațiile sale din Tratatul cu Rusia i-au cerut să facă acest lucru. La început războiul a mers prost., În 1788, austriecii au așteptat ca rușii să ia ofensiva pe meleagurile românești—pe care nu au reușit—doar pentru a fi ei înșiși atacați de turci și trimiși la nord de Dunăre în încercarea de a-și reconsolida liniile. Iosif însuși a fost prezent în această campanie, care nu a făcut nimănui nimic bun. Nu și-a putut inspira ofițerii să fie mai agresivi și a devenit destul de bolnav, atât de mult încât s-a întors la Viena la sfârșitul anului 1788 într-un efort de recuperare., Campania din 1789 a mers mult mai bine, rezultând în cucerirea austriacă a cetății importante a Belgradului la confluența râurilor Sava și Dunăre și într-o ofensivă comună Austro-rusă în Moldova și țara Românească care a condus turcii până la Dunăre.dar, în acest timp, toate consecințele nefericite ale politicii interne și externe a lui Iosif au fost afectate de el. Războiul în sine a provocat o revărsare de agitație populară împotriva politicii sale externe, oamenii din țările de Jos austriece au crescut într-o revoluție absolută, iar rapoartele de probleme din Galicia au crescut., În cele din urmă, Ungaria a fost cea care a rupt spiritul lui Iosif. În 1788 a trebuit să convoace vechile adunări județene pentru a cere recruți și provizii pentru a lupta în război. Nobilii care alcătuiau aceste adunări au răspuns cu proteste și au cerut ca vechea Constituție să fie restaurată și ca Iosif să se supună Încoronării în mod tradițional maghiar. Chiar și Cancelaria maghiară, Ministerul din guvernul central însărcinat cu afacerile maghiare, i-a recomandat lui Joseph să cedeze acestor dorințe ale alegătorilor săi.,confruntat cu aceste dificultăți, Joseph a revocat multe dintre reformele pe care le-a adoptat mai devreme. Într-o scrisoare din ianuarie 1790 el a subliniat bunele sale intenții în adoptarea noilor sale legi în Ungaria și apoi le-a revocat pe toate, cu excepția Edictului de tolerare, a legilor referitoare la statutul țăranilor și a reformelor monahale. El a fost de acord să convoace dieta maghiară—dar nu prea curând, având în vedere situația internațională periculoasă—și a consimțit să returneze coroana Ungariei și să se încoroneze ca rege al acestei țări., Cu toate acestea, încoronarea nu s-a întâmplat niciodată, deoarece Iosif a murit în luna următoare.