valg og forberedelserne til det sydlige uafhængighed
ICC arrestordre syntes at have meget lidt indflydelse på Bashir ‘ s popularitet i Sudan, og i April 2010 blev han genvalgt som præsident med nogle 68 procent af stemmerne i landets første demokratiske valg i mere end 20 år., Salva Kiir, der havde været tjener som national første vicepræsident under Bashir og som formand for den semi-autonome regering i sydsudan siden død af John Garang i 2005, fik næsten 93 procent af stemmerne til at fortsætte tjener i denne egenskab. Valgresultatet blev overskyet af tilbagetrækningen af Bashirs to vigtigste oppositionskandidater forud for konkurrencen, som hævdede, at der allerede var tegn på svigagtig praksis, og af erklæringen fra nogle internationale observatører om, at valget ikke levede op til internationale standarder.,
på betingelserne i 2005 CPA stemte Sydsudanske borgere 9.-15. januar 2011 i den ivrigt ventede folkeafstemning om sydlig uafhængighed. Bortset fra nogle få isolerede tilfælde af vold, folkeafstemningen skete fredeligt, og internationale observatører erklærede afstemningen for at være troværdig og stort set fri og retfærdig., Den anden folkeafstemning i første omgang planlagt til at ske på samme tid for indbyggerne i Abyei-regionen, om, at regionen vil være en del af nord eller syd, i det tilfælde, at sidstnævnte valgt uafhængighed, blev udskudt på ubestemt tid på grund af uenighed om stemmeret i den region.foreløbige resultater i den sydlige uafhængighedsafstemning, der blev frigivet i slutningen af januar, indikerede, at næsten 99 procent af vælgerne valgte at løsrive sig fra nord; dette blev bekræftet med meddelelsen om de endelige resultater i Februar., Landet kiggede derefter mod de endelige forberedelser til sydens løsrivelse, der var planlagt til 9.juli 2011. Forberedelserne til splittelsen gik dog ikke glat. Som juli uafhængighed dato voksede tættere, på flere vigtige problemer forblev uløste mellem nord og syd, såsom deling af landets olie rigdom, fordeling af landets kollektive gæld, og etablering af den endelige grænsedragning.
relateret til det uløste grænsespørgsmål var en alarmerende situation i den omstridte Abyei-region., I henhold til CPA 2005 blev regionen administreret i fællesskab af nordlige og sydlige sudanesere, indtil dens endelige status kunne fastlægges, hvilket med den ubestemt udsættelse af Abyei-folkeafstemningen stadig var verserende. Der havde været spredte mængder af lavt niveau vold i Abyei, men spændingerne nåede en ny højde i maj 2011, da Bashir beordrede invasionen af regionens primære by, også kaldet Abyei., Han fastholdt, at invasionen var et begrundet svar til det sydlige provokation, med henvisning til et angreb fra det sydlige kæmpere på det nordlige styrker og deres FN-fredsbevarende tropper ledsagere et par dage tidligere, men invasionen blev bredt fordømt i internationale cirkler, og fremkaldte skriger af protest fra den sydlige Sudans regering. Titusinder af Abyei-beboere blev fordrevet af konflikten., Dage senere, da Bashir proklamerede Abyei at være nordlige land og nægtede at trække den nordlige tropper, mange frygtede, at den ophedede situation kunne blusse op igen borgerkrig i landet, men en aftale, der blev indgået i juni, at der er fastsat en ny, midlertidig nord-syd-administrationen i regionen samt for inddragelse af både det nordlige og sydlige styrker fra regionen. Etiopiske fredsbevarende tropper blev enige om at danne en midlertidig sikkerhedsstyrke for Abyei.,
Meanwhile, another conflict had developed in the central Sudanese state of Southern Kordofan, which shared a border with the soon-to-be-independent south., Selvom det teknisk set var i den nordlige del af landet, sydlige Kordofan var hjemsted for Nuba-folket og tusinder af krigere, der havde allieret sig med syd under borgerkrigen; staten havde også meget af de oliereserver, der skulle forblive i nord efter det sydlige Sudans uafhængighed. Kampene mellem syd-linie kræfter og den Sudanesiske hær brød ud i begyndelsen af juni, med hver side beskylder andre for anstiftelse af sammenstødene, og konflikten eskalerede, da den Sudanske hær lanceret en voldelig kampagne for at afslutte, hvad de anses for at være et oprør., Konflikten resulterede i mange civile tab og udbredt forskydning af statens befolkning. I slutningen af juni AU forhandlet en aftale mellem den Sudanesiske regering og opposition i det Sydlige Kordofan, SPLM (senere SPLM-Nord), for at afslutte kampe og adresse status for de nordboere, der havde kæmpet på den side af syd under borgerkrigen, og som giver enten deres demobilisering eller integration i den Sudanesiske hær., Aftalen udvides også til den nærliggende Blue Nile-stat, hvilken, skønt ikke grebet af det samme niveau af vold som fundet i Det Sydlige Kordofan, også var hjemsted for mange tidligere sydlige krigere.
de seneste fjendtligheder og resterende uløste løsrivelsesspørgsmål var stærkt, da sydens planlagte uafhængighedsdato voksede tættere., Med mindre end en uge før syd var planlagt til at løsrive sig, nord og syd er enige om at fortsætte drøftelserne om deres uløste spørgsmål—herunder de centrale spørgsmål i olie-indtægter, deling og en endelige grænsedragning—efter de syd erklærede sin uafhængighed. Sydens løsrivelse fandt sted som planlagt den 9.juli 2011.