hacia el final del reinado de José, hubo de hecho una creciente insatisfacción. Los elementos religiosos estaban descontentos con muchas de sus reformas, y tanto los señores como los campesinos estaban preocupados por lo que sus cambios agrícolas significarían para su futuro. Además, otras pocas políticas han inspirado resistencia., En 1784 informó al gobierno húngaro que su idioma oficial, el latín, no era efectivo para el gobierno moderno y, dado que el Húngaro era hablado por solo una parte de la población de ese reino, que el idioma del gobierno a partir de entonces sería el alemán. Ese lenguaje se utilizaría inmediatamente en las oficinas centrales, en las oficinas de Condado después de un año y en las oficinas locales después de tres. El empleo en el gobierno e incluso la membresía en la dieta húngara estarían abiertos solo a los hablantes de alemán., Aunque fue diseñado para facilitar la administración, muchos húngaros interpretaron este fallo lingüístico como una amenaza para toda su cultura y hablaron con entusiasmo en contra de él. Para agravar el horror de los húngaros, José se negó a someterse a una coronación en Hungría para no tener que jurar defender leyes que no deseaba, y luego hizo que la corona sagrada del reino se trasladara a Viena.
en 1787 la resistencia a José y su gobierno se estaba intensificando., Una posesión de los Habsburgo que había escapado a las reformas durante el reinado de María Teresa y José fue la Holanda austríaca, que se gobernó bajo sus propias leyes. En enero y marzo de 1787 José simplemente barrió la Constitución de los Países Bajos austríacos y anunció que a partir de entonces sería gobernada de acuerdo con principios absolutistas, al igual que las otras provincias de la monarquía. La resistencia hierve a fuego lento en los Países Bajos Austríacos hasta 1789, cuando se convirtió en una revuelta abierta, obligando a la administración a huir a un lugar seguro en el Ducado de Luxemburgo., En ese momento también había rumores de rebelión en Hungría y en Galicia, y durante un período parecía como si la revolución podría estallar en muchas partes de la monarquía.
Las reformas de José podrían no haber generado tanta oposición si no hubiera sido por su política exterior. José no fue especialmente agresivo en asuntos exteriores, pero siguió el Consejo anti-prusiano de su antiguo canciller y el de su madre, Kaunitz, y ese consejo terminó en desgracia. Kaunitz creía firmemente que Austria podía controlar a Prusia solo con la ayuda de Rusia., En consecuencia, en 1781 él y José negociaron con Catalina La Grande un pacto que preveía la ayuda rusa para Austria en caso de guerra con Prusia. A cambio, Austria prometió ayudar a Rusia en caso de guerra con el Imperio Otomano. Confiada en su fuerza diplomática y militar, Catalina se involucró en una serie de provocaciones hacia los turcos que resultaron en 1787 en una declaración de guerra por el sultán. Aunque José no tenía ningún deseo real de participar en esta guerra, sus obligaciones de tratado con Rusia le obligaron a hacerlo. Al principio la guerra fue mal., En 1788, los austriacos esperaron a que los rusos tomaran la ofensiva en tierras rumanas, lo que no lograron hacer, solo para ser atacados por los turcos y enviados corriendo hacia el norte desde el Danubio en un esfuerzo por reconsolidar sus líneas. José mismo estuvo presente en esta campaña, que no hizo ningún bien a nadie. No pudo inspirar a sus oficiales a ser más agresivos, y se enfermó bastante, tanto que regresó a Viena a finales de 1788 en un esfuerzo por recuperarse., La campaña de 1789 fue mucho mejor, lo que resultó en la conquista austriaca de la importante fortaleza de Belgrado en la confluencia de los ríos Sava y Danubio y en una ofensiva conjunta Austro-rusa en Moldavia y Walaquia que condujo a los turcos hasta el Danubio.
pero en este momento todas las consecuencias desafortunadas de la política interior y exterior de José se estaban cargando sobre él. La guerra en sí causó un torrente de agitación popular contra su política exterior, el pueblo de los Países Bajos Austríacos se levantó en una revolución abierta, y los informes de problemas en Galicia aumentaron., Finalmente, fue Hungría la que rompió el espíritu de José. En 1788 tuvo que convocar a las Asambleas del viejo condado para pedir reclutas y Suministros para luchar en la guerra. Los nobles que formaban estas asambleas respondieron con protestas y demandas de que se restaurara la antigua Constitución y que José se sometiera a la coronación a la manera tradicional húngara. Incluso la Cancillería húngara, el Ministerio del gobierno central a cargo de los asuntos húngaros, recomendó que José ceda a estos deseos de sus electores.,
ante estas dificultades, José revocó muchas de las reformas que había promulgado anteriormente. En una carta de enero de 1790 enfatizó sus buenas intenciones al promulgar sus nuevas leyes en Hungría y luego revocó todas ellas, excepto el Edicto de tolerancia, las leyes relacionadas con el estatus de los campesinos y las reformas monásticas. Accedió a llamar a la dieta húngara-pero no demasiado pronto, dada la peligrosa situación internacional—y consintió en devolver la corona a Hungría y a su propia coronación como rey de ese país., La coronación nunca llegó a suceder, sin embargo, porque José murió al mes siguiente.