Sentido (biología molecular)

debido a la naturaleza complementaria del emparejamiento de bases entre polímeros de ácido nucleico, una molécula de ADN de doble cadena estará compuesta de dos hebras con secuencias que son complementos inversos entre sí. Para ayudar a los biólogos moleculares a identificar específicamente cada hebra individualmente, las dos hebras generalmente se diferencian como la hebra «sentido» y la hebra «antisentido»., Una hebra individual de ADN se conoce como sentido positivo (también positivo ( + ) o simplemente sentido) si su secuencia de nucleótidos corresponde directamente a la secuencia de una transcripción de ARN que se traduce o traducible a una secuencia de aminoácidos (siempre que cualquier base de timina en la secuencia de ADN se reemplace con bases de uracilo en la secuencia de ARN). La otra hebra de la molécula de ADN de doble cadena se conoce como sentido negativo (también negativo (-) o antisentido), y es inversa complementaria tanto a la hebra de sentido positivo y la transcripción de ARN., En realidad, es la cadena antisentido la que se utiliza como la plantilla a partir de la cual las ARN polimerasas construyen la transcripción de ARN, pero el emparejamiento de bases complementario por el cual se produce la polimerización de ácido nucleico significa que la secuencia de la transcripción de ARN se verá idéntica a la cadena de sentido, aparte del uso de uracilo en lugar de timina en la transcripción de ARN.

a veces las frases que codifican la cadena y la cadena de la plantilla se encuentran en lugar de sentido y antisentido, respectivamente, y en el contexto de una molécula de ADN de doble cadena el uso de estos términos es esencialmente equivalente., Sin embargo, la cadena de codificación/sentido no siempre necesita contener un código que se utiliza para hacer una proteína; tanto los ARN codificadores de proteínas como los no codificadores pueden ser transcritos.

los Términos «sentido » y» antisentido » son relativos solo a la transcripción de ARN en cuestión, y no a la cadena de ADN como un todo. En otras palabras, cualquiera de las cadenas de ADN puede servir como la cadena de sentido o antisentido. La mayoría de los organismos con genomas suficientemente grandes hacen uso de ambas hebras, con cada hebra funcionando como la hebra plantilla para diferentes transcripciones de ARN en diferentes lugares a lo largo de la misma molécula de ADN., En algunos casos, las transcripciones de ARN pueden ser transcritas en ambas direcciones (es decir, en cualquiera de las hebras) desde una región promotora común, o ser transcritas desde intrones en cualquiera de las hebras (ver «ambisense» más abajo).

Dnaeditar antisentido

la cadena del sentido del ADN se parece a la transcripción del ARN mensajero (ARNm), y por lo tanto se puede usar para leer la secuencia de codones esperada que finalmente se utilizará durante la traducción (síntesis de proteínas) para construir una secuencia de aminoácidos y luego una proteína., Por ejemplo, la secuencia » ATG » dentro de una cadena de sentido de ADN corresponde a un codón «AUG» en el ARNm, que codifica para el aminoácido metionina. Sin embargo, la cadena de sentido del ADN en sí no se utiliza como la plantilla para el ARNm; es la cadena antisentido del ADN que sirve como la fuente para el código de la proteína, porque, con bases complementarias A la cadena de sentido del ADN, se utiliza como una plantilla para el ARNm. Dado que la transcripción resulta en un producto de ARN complementario a la hebra plantilla de ADN, el ARNm es complementario a la hebra antisentido de ADN.,

esquema que muestra cómo las hebras de ADN antisentido pueden interferir con la traducción de proteínas

por lo tanto, un triplete de base 3′-TAC-5′ en la hebra antisentido de ADN (complementario al 5′-ATG-3′ de la hebra Aug-3’triplete base en el ARNm. La hebra del sentido del ADN tendrá el triplete ATG, que se parece al triplete de ARNm AUG, pero no se utilizará para hacer metionina porque no se utilizará directamente para hacer ARNm., La hebra de sentido del ADN se llama hebra de «sentido» no porque se use para hacer proteínas (no lo será), sino porque tiene una secuencia que corresponde directamente a la secuencia del codón de ARN. Por esta lógica, la transcripción del ARN en sí a veces se describe como»sentido».,

ejemplo con ADN de doble cadena

cadena de ADN 1: cadena antisentido (transcrita a) → cadena de ARN (sense) cadena de ADN 2: cadena de sentido

algunas regiones dentro de una molécula de ADN de doble cadena codifican genes, que generalmente son instrucciones que especifican el orden en el que los aminoácidos se ensamblan para hacer proteínas, así como secuencias reguladoras, sitios de empalme, intrones no codificantes y otros productos genéticos. Para que una célula utilice esta información, una hebra del ADN sirve como plantilla para la síntesis de una hebra complementaria de ARN., La cadena de ADN transcrita se llama la cadena plantilla, con secuencia antisentido, y la transcripción de ARNm producida a partir de ella se dice que es la secuencia de sentido (el complemento de antisentido). La cadena de ADN no transcrita, complementaria a la cadena transcrita, también se dice que tiene secuencia de sentido; tiene la misma secuencia de sentido que la transcripción de ARNm (aunque las bases T en el ADN se sustituyen por bases U en el ARN).

3’CGCTATAGCGTTT 5′ DNA antisentido strand (template/noncoding) utilizado como plantilla para la transcripción.,
5′GCGATATCGCAAA 3′ DNA sense strand (nontemplate/coding) Complementary to the template strand.
5′GCGAUAUCGCAAA 3′ mRNA sense transcript RNA strand that is transcribed from the noncoding (template/antisense) strand. Note1: Except for the fact that all thymines are now uracils (T → U), it is complementary to the noncoding (template/antisense) DNA strand and identical to the coding (nontemplate/sense) DNA strand.,
3’CGCUAUAGCGUUU 5′ mRNA antisense transcript cadena de ARN que se transcribe de la cadena de codificación (nontemplate/sense). Nota: excepto por el hecho de que todos los thymines son ahora uracilos (T → U), es complementario a la cadena de ADN codificante (nontemplate/sense) e idéntico a la cadena de ADN no codificante (plantilla/antisentido).,

los nombres asignados a cada hebra en realidad dependen de la dirección en la que está escribiendo la secuencia que contiene la información de las proteínas (la información de» sentido»), no en qué hebra se representa como» en la parte superior «o» en la parte inferior » (lo cual es arbitrario)., La única información biológica que es importante para etiquetar las hebras es la ubicación relativa del grupo fosfato Terminal 5′ y el grupo hidroxilo terminal 3′ (en los extremos de la hebra o secuencia en cuestión), porque estos extremos determinan la dirección de transcripción y traducción. Una secuencia escrita 5′-CGCTAT-3′ es equivalente a una secuencia escrita 3′-TATCGC-5′ mientras la 5′ y 3′ extremos se nota. Si los extremos no están etiquetados, la Convención es asumir que ambas secuencias están escritas en la dirección 5’a 3′., La » hebra de Watson «se refiere a la hebra superior de 5’a 3′ (5’→3′), mientras que la» hebra de Crick «se refiere a la hebra inferior de 5’a 3′ (3’←5′). Las hebras de Watson y Crick pueden ser hebras sensoriales o antisentidas dependiendo del producto genético específico hecho de ellas.,

por ejemplo, la notación «YEL021W», un alias del gen URA3 utilizado en la base de datos del National Center for Biotechnology Information (NCBI), denota que este gen se encuentra en el 21st open reading frame (ORF) del centrómero del brazo izquierdo (L) del número de cromosoma de levadura (y) V (E), y que la cadena de codificación de expresión es la cadena de Watson (W). «YKL074C» denota la 74ª ORF a la izquierda del centrómero del cromosoma XI y que la cadena codificante es la cadena Crick (C). Otro término confuso que se refiere a» más «y» menos » también se usa ampliamente., Ya sea que la cadena Sea sense (positiva) o antisense (negativa), la secuencia de consulta predeterminada en la alineación de BLAST NCBI es la cadena «Plus».

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