pendant les guerres napoléoniennes en Europe, les colonies espagnoles du nouveau monde ont commencé à administrer leurs propres affaires., L’autonomie croissante a finalement entraîné le mouvement vers l’indépendance, et les Provinces Unies du Río de la Plata, aujourd’hui connues sous le nom D’Argentine, ont proclamé leur souveraineté sous un tricolore horizontal Bleu-Blanc-Bleu. Ce drapeau de libération a été porté par le corsaire Luís Aury aux Caraïbes en 1818. Bien qu’il n’ait survolé que brièvement les îles Santa Catalina au large des côtes de l’Amérique centrale, le drapeau a inspiré les sujets espagnols de la région qui cherchaient leur liberté., L’indépendance de L’Amérique centrale a été proclamée pour la première fois le 15 septembre 1821 et a été réaffirmée, après deux ans de domination mexicaine, en 1823. Le chef du mouvement contre la domination mexicaine était le Colonel Manuel José Arce D’El Salvador. Son drapeau de bandes horizontales bleu-blanc-bleu a été béni dans l’église de San Salvador le 20 février 1822 et est finalement devenu le drapeau national des Provinces-Unies d’Amérique centrale.
Après l’éclatement des Provinces-Unies D’Amérique centrale en cinq pays distincts, El Salvador a continué à utiliser son drapeau jusqu’en 1865., Puis, pendant plus de quatre décennies, un drapeau national différent a été utilisé, qui ressemblait aux Stars and Stripes des États-Unis. Le 15 septembre 1912, cependant, le drapeau bleu-blanc-bleu a été réintroduit. Avec des modifications mineures (la dernière en septembre 1972), il se présente aujourd’hui comme un rappel de l’Unité de l’Amérique centrale. Les armoiries au centre du drapeau ressemblent à celles utilisées par l’ancienne fédération D’Amérique centrale et comprennent la devise nationale « Dios, unión, libertad” (« Dieu, union, liberté”). Voir aussi l’histoire des drapeaux du Guatemala, du Nicaragua, du Costa Rica et du Honduras.