Fun Avec des Champignons: Mycologie Carrières

Bidartondo déménagé à Kew, en juillet 2004, après avoir terminé ses recherches à l’université de Berkeley. C’est là qu’il passe le plus clair de son temps, bien qu’il ait un rendez-vous conjoint avec L’Imperial College London, qui vise à créer un partenariat de recherche sur la biodiversité entre les deux institutions., À L’Imperial, Bidartondo donne des conférences de troisième cycle sur les champignons, l’écologie et la conservation, tandis qu’à Kew, il fait des recherches liées à ses travaux de deuxième cycle, étudiant la coévolution des plantes et des champignons. Bidartondo est satisfait de la situation, dit-il, parce que « je fais l’expérience de deux environnements avec des façons de travailler très différentes., »

race Rare

(Beth Elzer/Imperial College de Londres)

Martin Bidartondo

Mycologues comme Bidartondo sont une race rare, et la demande pour les champignons des scientifiques est relativement faible. Dans le même temps, il semble y avoir une pénurie de personnes qualifiées pour occuper ces quelques emplois en mycologie. Mais avec persévérance et amour pour les champignons, les mycologues peuvent trouver du travail dans de nombreux domaines, de la recherche universitaire à l’agriculture appliquée.,

La mission de Kew en mycologie est d’accroître les connaissances sur les champignons en identifiant et en décrivant de nouvelles familles, genres et espèces au Royaume-Uni et à l’étranger. C’est un défi de taille pour un si petit département, soutient Brian Spooner, chef du département de mycologie de Kew. À L’exception de Bidartondo, qui travaille principalement en écologie moléculaire, Kew compte trois mycologues dédiés à l’identification de nouvelles espèces et à l’entretien de la collection de champignons de L’herbier de Kew. C’est » à peine suffisant pour répondre aux demandes de prêt et à la curation », dit Spooner.,

en plus des objectifs taxonomiques, les mycologues de Kew fournissent des avis d’experts et offrent une assistance aux autorités publiques et au grand public sur les aspects pratiques de la mycologie, des empoisonnements aux conseils sur les champignons pourris. Par exemple, « nous avons reçu une demande d’information de la police dans un cas d’empoisonnement présumé probablement causé par L’Amanita », explique Heidi Döring, responsable de laboratoire et mycologue taxonomique à Kew. « Nous recevons également des demandes de propriétaires d’animaux ou de vétérinaires concernant les champignons qui ont été mangés par les chiens., »

les mycologues ayant une formation et un intérêt pour la taxonomie sont devenus difficiles à trouver ces dernières années. Kew n’a pas réussi à pourvoir les postes annoncés en systématique de l’herbe et en mycologie en raison d’un manque de candidats ayant une expérience appropriée, explique Spooner. La taxonomie classique, qui utilise des caractéristiques morphologiques pour identifier les espèces, est remplacée par des techniques de codage à barres de l’ADN qui utilisent des gènes pour distinguer les espèces précédemment connues. Mais ne regarder que les gènes n’aide pas la découverte de nouvelles espèces de champignons.,

les mycologues classiques ont formellement décrit environ 70 000 espèces de champignons, mais « on estime qu’il y a au moins 1,5 million d’espèces présentes sur les plantes seules », explique Pedro Crous, président de L’Association mycologique internationale. Si d’autres niches, telles que le sol, étaient étudiées en détail, des millions d’espèces supplémentaires seraient trouvées, ajoute-t-il. Compte tenu de la valeur pharmaceutique et nutritionnelle du groupe, si aucun nouveau champignon n’est décrit, « qui sait ce qui nous manque? »Demande Spooner.,

Fungi careers

(avec la permission, John Collier )

John Collier

grâce à cette valeur pharmaceutique et nutritionnelle, « avec une formation en mycologie, vous êtes en mesure de travailler dans de nombreux secteurs de la société en dehors du monde universitaire », explique le CROUS., « Les champignons ont beaucoup de potentiel pour les médicaments anticancéreux ou la bioremédiation des zones polluées », explique le mycologue John Collier, 34 ans, directeur de la recherche et du développement chez Monaghan Mushrooms, un producteur de champignons frais en Irlande.

comme Bidartondo, Collier s’est intéressé aux champignons dès son plus jeune âge, cueillant des champignons dans les champs autour de sa maison D’enfance en Irlande. Il a poursuivi son intérêt pour la botanique et les champignons en se spécialisant en sciences végétales à L’University College Dublin en Irlande, en prenant autant de cours en mycologie que possible., Alors qu’il était à l’Université, Collier a lu un livre intitulé Murder, Magic, and Medicine sur l’utilisation de produits chimiques provenant de plantes et de champignons dans les poisons, les médicaments et les drogues. Le livre « m’a inspiré à en apprendre davantage sur les composés que les plantes et les champignons produisent pour se protéger des ravageurs et des concurrents et pour augmenter leurs chances de fertilisation et de dispersion », dit-il.

son intérêt pour les applications médicales des plantes l’a amené à effectuer un doctorat à Dublin pour étudier la production de produits pharmaceutiques dans des cultures de cellules végétales., Après quelques années de travail dans le brevetage et la commercialisation de la recherche universitaire, Collier est retourné dans le milieu universitaire pour un postdoctorat, étudiant l’utilisation d’extraits fongiques médicinaux dans les boissons laitières. En octobre 2007, Collier a rejoint Monaghan Mushrooms pour créer un département de recherche et développement au sein de la société. L’objectif: améliorer les technologies de base de l’entreprise et diversifier son activité en explorant de nouveaux domaines de l’économie des champignons.

Collier dirige six scientifiques dans deux équipes. Une équipe travaille à améliorer les rendements des champignons et la qualité du compost de champignons., La deuxième équipe travaille sur « une gamme de projets », dit-il, en appliquant les déchets de champignons dans de nouveaux domaines tels que les énergies renouvelables et l’industrie chimique. En tant que visage de la recherche de L’entreprise, Collier interagit avec des scientifiques universitaires et assiste à des conférences scientifiques relatives aux champignons et à leurs effets économiques potentiels. « C’est un rôle très varié, et je ne fais jamais la même chose 2 jours de suite », dit-il.,

la recherche industrielle consacrée à la mycologie est encore rare, mais Collier pense que d’autres entreprises suivront L’exemple de Monaghan car les avantages économiques potentiels de l’investissement scientifique sont importants. En outre, « le génome des champignons est encore très inconnu, et comme plus de recherches sont faites dans ce domaine, nous obtiendrons une meilleure compréhension des gènes des champignons et comment ils peuvent être manipulés », ajoute-t-il.

apprendre les ficelles du métier

parce que les champignons jouent un rôle important dans l’agriculture, les mycologues peuvent trouver des emplois en tant que phytopathologistes, agents de quarantaine, inspecteurs ou producteurs de champignons., « Il existe de nombreuses options pour les mycologues dans ce domaine, et il en va de même pour le secteur de la santé ou les domaines appliqués où les champignons causent des problèmes et détériorent les produits ou réduisent la qualité de vie », ajoute le Crous.,

pourtant, « L’enseignement de la mycologie a en quelque sorte perdu ses foyers traditionnels dans de nombreux départements de botanique », explique Paul Szaniszlo, professeur de Génétique Moléculaire et de microbiologie à L’Université du Texas, Austin, ajoutant qu’il n’est au courant d’aucun programme spécifique à la mycologie aux États-Unis, mais que les sciences des champignons sont, En raison du manque de possibilités de formation formelle, les superviseurs ne s’attendent pas à ce que les étudiants potentiels aient une compréhension approfondie de la mycologie; au lieu de cela, ils recherchent un intérêt pour les champignons et une formation en sciences végétales, en microbiologie ou en bioinformatique.

comme le démontrent Bidartondo et Collier, la formation en tant que mycologue signifie généralement reporter la spécialisation au moins jusqu’aux études supérieures. « Il n’y a pas B.Sc. cours de degré en mycologie AU ROYAUME-UNI », explique Gareth Griffith de L’Université D’Aberystwyth au Royaume-Uni, bien que certains départements offrent des cours de premier cycle sur le sujet., Le type de mycologie enseigné varie selon les universités: Aberystwyth, par exemple, a « une inclinaison plus forte sur l’écologie fongique et la pathologie végétale, alors que les universités avec une microbiologie fortement médicale B.Sc. schéma aurait tendance à se concentrer sur les champignons pathogènes », ajoute Griffith. Au niveau de la maîtrise, University College London offre un programme en Mycologie Médicale.

le type de mycologie enseigné au niveau postuniversitaire dépend principalement des intérêts du chercheur principal et de la vision stratégique du département., Par exemple, l’Université Suédoise D’Agriculture D’Uppsala et le laboratoire de Matteo Garbelotto à Uc Berkeley ont actuellement des ouvertures en mycologie forestière, qui se concentre sur les maladies fongiques des arbres telles que la mort subite du chêne. Au Royaume-Uni, « L’Université D’Exeter est actuellement un foyer d’activités de recherche sur les champignons en tant que pathogènes des plantes, tandis Qu’Aberdeen a un large éventail d’intérêts mycologiques, y compris les agents pathogènes animaux et les champignons mycorhiziens », explique Lynne Boddy, présidente de la British Mycological Society.,

malgré la pénurie actuelle de mycologues, Collier est optimiste quant à l’avenir du domaine. Les nouvelles opportunités commerciales créées par l’industrie des champignons, les énergies renouvelables, la remédiation Écologique et, en particulier, l’industrie pharmaceutique ne manqueront pas de « susciter de l’intérêt pour la mycologie et, à son tour, de créer de nouveaux emplois », dit-il.

photo (en haut): Jon Mitchell

Sara Coelho est une ancienne stagiaire de Science News.,