« bien que nous soyons la proie d’un petit nombre de micro-organismes franchement pathogènes, nous sommes l’hôte d’innombrables bactéries commensales, champignons, protozoaires et infimes espèces d’insectes. Pour la plupart des espèces bactériennes commensales, leur réplication sur ou en nous est essentielle à leur survie. De plus, notre propre survie dépend probablement de la présence de ces micro-organismes. S. Falkow. 1997. ASM Nouvelles 63: 359-365.,
Acquisition de la flore corporelle normale
avant la naissance, la plupart des humains sont essentiellement stériles microbiologiquement. Il y a des virus et des bactéries qui peuvent traverser la barrière placentaire, mais ces événements sont rares. Notre première exposition à un grand nombre de micro-organismes est occasionnée par notre court voyage dans le canal de naissance, bien que cette exposition soit un peu retardée pour près de 30% des bébés nés par césarienne., Cette exposition initiale à la riche population microbienne du canal génital de la mère provoque rarement des problèmes, bien qu’elle entraîne l’inoculation de la peau, du nasopharynx et de l’intestin du nouveau-né avec une variété de micro-organismes, qui ne persistent pas tous dans les tissus du bébé. La manipulation, les câlins, le nettoyage et les soins infirmiers contribuent à accroître le nombre d’espèces microbiennes qui ont une prise au pied (prise de biofilm?) au new-charge.,
le régime alimentaire des nouveau-nés joue un rôle décisif dans la population microbienne de l’intestin, la flore des nourrissons allaités étant dominée par des organismes tels que Bifidobacteriumbifidus. La Transition vers le lait de vache ou la formule à base de lait favorise la croissance de coliformes producteurs de gaz, une transition généralement considérée par les parents comme un changement olfactif lorsque le changement de couche est nécessaire., Des changements alimentaires continus ont lieu à mesure que le régime alimentaire devient de plus en plus complexe, prenant éventuellement les caractéristiques de l’intestin adulte avec une prédominance d’organismes tels que Bacteroides spp, Fusobacterium spp, cocci anaérobies, entérocoques, levures et protozoaires.
une succession écologique similaire se produit dans pratiquement toutes les zones colonisées du corps, bien que les taux de changement et les représentants microbiens spécifiques diffèrent considérablement d’un système organique à l’autre.,
dans la bouche par exemple, la première apparition des dents coïncide avec l’apparition de nombreuses espèces de streptocoques dont S. sanguis. Cet organisme devient une composante majeure de la flore buccale adulte.Mais S. sanguis est rejoint par une foule d’autres habitants, qui se coagulent les uns avec les autres dans une série d’appariements d’une précision exquise conduisant à une succession écologique imitant à bien des égards la succession des plantes dans une forêt nouvellement défrichée., Dans L’une des enquêtes les plus approfondies sur les micro-organismes buccaux, Paul Kolenbrander a identifié jusqu’à 600 espèces différentes qui se trouvent dans la bouche (Référence nécessaire).