Sense (biologie moléculaire)

en raison de la nature complémentaire de l’appariement des bases entre les polymères d’acides nucléiques, une molécule D’ADN double brin sera composée de deux brins avec des séquences qui sont des compléments inverses l’un de l’autre. Pour aider les biologistes moléculaires à identifier spécifiquement chaque brin individuellement, les deux brins sont généralement différenciés en tant que brin « sens » et brin « antisens »., Un brin individuel d’ADN est appelé sens positif (également positif (+) ou simplement sens) si sa séquence nucléotidique correspond directement à la séquence d’une transcription D’ARN qui est traduite ou traduisible en une séquence d’acides aminés (à condition que toutes les bases de thymine de la séquence D’ADN soient remplacées par des bases d’uracile dans la séquence D’ARN). L’autre brin de la molécule D’ADN double brin est appelé négatif-sens (également négatif ( – ) ou antisens), et est complémentaire inverse du brin positif-sens et de la transcription D’ARN., C’est en fait le brin antisens qui est utilisé comme modèle à partir duquel les ARN polymérases construisent la transcription de l’ARN, mais l’appariement de base complémentaire par lequel la polymérisation des acides nucléiques se produit signifie que la séquence de la transcription de l’ARN sera identique au brin de sens, en dehors de l’utilisation de la transcription

parfois, les expressions coder strand et template strand sont rencontrées à la place de sense et antisense, respectivement, et dans le contexte d’une molécule D’ADN double brin, l’utilisation de ces termes est essentiellement équivalente., Cependant, le brin de codage/sens ne doit pas toujours contenir un code utilisé pour fabriquer une protéine; les ARN codants et non codants peuvent être transcrits.

les Termes « sens » et « antisens » ne sont relatifs qu’à la transcription particulière de L’ARN en question, et non au brin D’ADN dans son ensemble. En d’autres termes, l’un ou l’autre brin D’ADN peut servir de brin sens ou antisens. La plupart des organismes avec des génomes suffisamment grands utilisent les deux brins, chaque brin fonctionnant comme le brin modèle pour différents transcriptions D’ARN à différents endroits le long de la même molécule d’ADN., Dans certains cas, les transcriptions D’ARN peuvent être transcrites dans les deux directions (c.-À-D. sur l’un ou l’autre brin) à partir d’une région promotrice commune, ou être transcrites à partir d’introns sur l’un ou l’autre brin (voir « ambisense » ci-dessous).

DNAEdit antisens

le brin DNA sense ressemble à la transcription de L’ARN messager (ARNm), et peut donc être utilisé pour lire la séquence de codon attendue qui sera finalement utilisée lors de la traduction (synthèse de protéines) pour construire une séquence d’acides aminés puis une protéine., Par exemple, la séquence « ATG » dans un brin de sens de L’ADN correspond à un codon « AUG » dans l’ARNm, qui code pour l’acide aminé méthionine. Cependant, le brin sens de L’ADN lui-même n’est pas utilisé comme modèle pour l’ARNm; c’est le brin antisens de l’ADN qui sert de source pour le code de la protéine, car, avec des bases complémentaires au brin sens de l’ADN, il est utilisé comme modèle pour l’ARNm. Puisque la transcription a comme résultat un produit D’ARN complémentaire au brin de modèle D’ADN, l’ARNm est complémentaire au brin antisens d’ADN.,

schéma montrant comment les brins d’ADN antisens peuvent interférer avec la traduction des protéines

Par conséquent, un triplet de base 3′-TAC-5′ dans le brin antisens de L’ADN (complémentaire au 5′-ATG-3′ du brin sens de L’ADN) est utilisé-triplet de base de 3’dans l’ARNm. Le brin de détection de L’ADN aura le triplet ATG, qui ressemble au triplet D’ARNm AUG mais ne sera pas utilisé pour fabriquer de la méthionine car il ne sera pas directement utilisé pour fabriquer l’ARNm., Le brin sens de L’ADN est appelé un brin « sens » non pas parce qu’il sera utilisé pour fabriquer des protéines (ce ne sera pas le cas), mais parce qu’il a une séquence qui correspond directement à la séquence de codon D’ARN. Par cette logique, la transcription de L’ARN elle-même est parfois décrite comme « sens ».,

exemple avec DNAEdit double brin

brin D’ADN 1: brin antisens (transcrit en) → brin D’ARN (sens) brin D’ADN 2: brin sens

certaines régions dans une molécule d’ADN double brin code pour les gènes, qui sont généralement des instructions spécifiant l’ordre dans lequel les acides aminés sont assemblés pour fabriquer des protéines, ainsi Pour qu’une cellule utilise cette information, un brin de L’ADN Sert de modèle pour la synthèse d’un brin complémentaire d’ARN., Le brin d’ADN transcrit est appelé le brin modèle, avec une séquence antisens, et la transcription de l’ARNm produite à partir de celui-ci est dite séquence sensorielle (le complément de l’antisens). Le brin D’ADN non transcrit, complémentaire au brin transcrit, aurait également une séquence sensorielle; il a la même séquence sensorielle que la transcription de l’ARNm (bien que les bases T dans L’ADN soient substituées par des bases U dans L’ARN).

3’CGCTATAGCGTTT 5′ brin antisens D’ADN (modèle/Non-codage) utilisé comme modèle pour la transcription.,
5′GCGATATCGCAAA 3′ DNA sense strand (nontemplate/coding) Complementary to the template strand.
5′GCGAUAUCGCAAA 3′ mRNA sense transcript RNA strand that is transcribed from the noncoding (template/antisense) strand. Note1: Except for the fact that all thymines are now uracils (T → U), it is complementary to the noncoding (template/antisense) DNA strand and identical to the coding (nontemplate/sense) DNA strand.,
3’CGCUAUAGCGUUU 5′ transcription antisens de l’ARNm brin D’ARN qui est transcrit à partir du brin codant (non standard / sens). Remarque: à l’exception du fait que toutes les thymines sont maintenant des uraciles (T → U), il est complémentaire au brin d’ADN codant (Non-template/sens) et identique au brin D’ADN non codant (modèle/antisens).,

les noms attribués à chaque brin dépendent en fait de la direction dans laquelle vous écrivez la séquence contenant les informations pour les protéines (les informations « sens »), et non du brin représenté comme « en haut » ou « en bas » (ce qui est arbitraire)., Les seules informations biologiques importantes pour le marquage des brins sont les emplacements relatifs du groupe phosphate terminal 5′ et du groupe hydroxyle terminal 3′ (aux extrémités du brin ou de la séquence en question), car ces extrémités déterminent la direction de la transcription et de la traduction. Une séquence écrite 5 ‘- CGCTAT-3′ est équivalente à une séquence écrite 3′-TATCGC-5′ tant que les extrémités 5′ et 3′ sont notées. Si les extrémités ne sont pas étiquetées, la convention est de supposer que les deux séquences sont écrites dans la direction 5’à 3’., Le  » brin Watson « fait référence au brin supérieur de 5’à 3′ (5’→3′), tandis que le » brin Crick « fait référence au brin inférieur de 5’à 3′ (3’←5′). Les brins Watson et Crick peuvent être des brins sens ou antisens en fonction du produit génétique spécifique fabriqué à partir d’eux.,

Par exemple, la notation « YEL021W », alias du gène URA3 utilisé dans la base de données du National Center for Biotechnology Information (NCBI), indique que ce gène se trouve dans le 21e cadre de lecture ouvert (ORF) du centromère du bras gauche (L) du chromosome de la levure (Y) numéro V (E), et que le brin codant « YKL074C » désigne le 74e ORF à gauche du centromère du chromosome XI et que le brin codant est le brin Crick (C). Un autre terme confus se référant à » plus  » et « moins » brin est également largement utilisé., Que le brin soit sens (positif) ou antisens (négatif), la séquence de requête par défaut dans NCBI BLAST alignment est le brin « Plus ».

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