o microbioma humano é a colecção de todos os microrganismos que vivem em associação com o corpo humano. Estas comunidades incluem eucariotas, archaea, bactérias e vírus. As bactérias em um corpo humano médio número dez vezes mais do que as células humanas, para um total de cerca de 1000 mais genes do que estão presentes no genoma humano. Devido ao seu pequeno tamanho, no entanto, os microorganismos compõem apenas cerca de 1 a 3 por cento da nossa massa corporal (ou seja, 2 a 6 libras de bactérias em um adulto de 200 libras)., Estes micróbios geralmente não são prejudiciais para nós, na verdade são essenciais para a manutenção da saúde. Por exemplo, eles produzem certas vitaminas que nós não temos os genes para fazer, quebrar nossos alimentos para extrair nutrientes que precisamos para sobreviver, ensinar nossos sistemas imunológicos como reconhecer invasores perigosos e até mesmo produzir compostos anti-inflamatórios úteis que combatem outros micróbios causadores de doenças., Um número cada vez maior de estudos demonstraram que as alterações na composição dos nossos microbiomas estão correlacionadas com numerosos estados da doença, aumentando a possibilidade de que a manipulação destas comunidades possa ser usada para tratar a doença.
O Projeto Microbiano Humano (HMP) foi apoiado pelos Institutos Nacionais de Saúde (NIH) Fundo Comum de 2007 a 2016, com a missão de gerar recursos que permitam a caracterização da microbiano humano e a análise do seu papel na saúde humana e doenças., Esta área do site centra-se no primeiro de um esforço de duas fases, frequentemente referido como HMP1, que decorreu de 2008 a 2013. A partir do sítio web do fundo comum:
O projecto microbioma humano passou do apoio do fundo comum. Os programas de fundos comuns são investimentos estratégicos que atingem um conjunto de objetivos de alto impacto dentro de um prazo de 5 a 10 anos. No final de cada programa, entrega transição para outras fontes de apoio ou uso pela comunidade científica mais ampla. O PGH foi apoiado pelo Fundo Comum de 2007 a 2016., O investimento não-HMP em pesquisa de microbiomas na NIH aumentou mais de quarenta vezes desde o início da HMP e abrange mais de 20 dos Institutos e centros de NIH. Por favor, note que uma vez que o HMP já não é suportado pelo Fundo Comum, o site do programa está sendo mantido como arquivo e não será atualizado regularmente.a microbiologia tradicional tem-se centrado historicamente no estudo de espécies individuais como unidades isoladas., No entanto, a grande maioria das espécies microbianas nunca foi isolada com sucesso como espécimes viáveis para análise, presumivelmente porque o seu crescimento depende de um microambiente específico que não foi, ou não pode ser, reproduzido experimentalmente. Avanços nas tecnologias de sequenciamento de DNA em meados da década de 2000 contribuíram para a criação de um novo campo de pesquisa, chamado metagenômica, permitindo um exame abrangente das comunidades microbianas sem a necessidade de cultivo., Em vez de examinar o genoma de uma estirpe bacteriana individual que foi cultivada num laboratório, a abordagem metagenómica examina a colecção de genomas derivados de comunidades microbianas amostradas de ambientes naturais. In HMP1, metagenomic methods complemented genomic analyses of known isolate strains, providing unprecedented information about the complexity of human microbial communities.,hmp1 caracterizou as comunidades microbianas encontradas em vários locais diferentes no corpo humano: vias nasais, cavidade oral, pele, tracto gastrointestinal e trato urogenital, e examinou o papel destes micróbios na saúde humana e na doença. Os 5 objetivos declarados do projeto foram o desenvolvimento de um conjunto de referência de 3.000 sequências de genoma microbiano isolado. Ao longo do projeto, 3.055 genomas isolados do corpo humano foram sequenciados para draft ou status completo. Leia mais sobre os esforços de sequenciamento do genoma de referência, incluindo acesso a metadados.,
HMP1 foi um esforço interdisciplinar composto por quatro centros de sequenciação (The Broad Institute, Baylor College of Medicine, Washington University School of Medicine, and the J., Craig Venter Institute), um centro de Análise de dados e coordenação (DACC), e vários investigadores independentes envolvidos em projetos de demonstração olhando mais de perto as associações entre o microbioma e saúde humana e doenças, desenvolvimento de ferramentas e tecnologia, e identificação de implicações éticas. Ver a composição completa do consórcio.