Seznam typů proteinů

„elementární aktivity, jako je katalýza nebo vazba, popisující působení genového produktu na molekulární úrovni. Daný genový produkt může vykazovat jednu nebo více molekulárních funkcí.“
Poznámka: další čtyři kategorie (níže) jsou obecné výchozí kategorie. Pokuste se najít konkrétnější funkční Kategorie (dále níže) pro proteiny než tyto obecné kategorie.

fyziologické proceseditovat

„Ty procesy, konkrétně vztahují k fungování integrovaného živé jednotky: buňky, tkání, orgánů a organismů.“…,

biologické proceseditovat

„fenomén označeny změny, které vedou k určitému výsledku, zprostředkované jednoho nebo více genových produktů.“

celulární procesedit

„procesy, které se provádějí na buněčné úrovni, ale nemusí být nutně omezeny na jednu buňku. Například buněčná komunikace probíhá mezi více než jednou buňkou, ale vyskytuje se na buněčné úrovni.“

buněčný fyziologický procesedit

“ procesy související s integrovanou funkcí buňky.,“

katalytická aktivitaedit

related_synonym:“enzymová aktivita“
“ katalýza biochemické reakce při fyziologických teplotách. V biologicky katalyzovaných reakcích jsou reaktanty známé jako substráty a katalyzátory jsou přirozeně se vyskytující makromolekulární látky známé jako enzymy. Enzymy mají specifická vazebná místa pro substráty a obvykle jsou složeny zcela nebo převážně z bílkovin, ale RNA, která má katalytickou aktivitu (ribozym), je často také považována za enzymatickou.“
Poznámka: viz Kategorie enzymů Wikipedie.,

aktivita aromatázyedit

  • viz Kategorie Wikipedia EC 1.14.14.

motor activityEdit

Katalýzy pohyb podél polymerní molekuly jako mikrovláken nebo mikroskopický, spolu k hydrolýze skupinou trifosfát. Zahrnuje také prokaryotické motory.
Poznámka: motorické proteiny myosinu, kinesinu a dyneinu jsou také v kategorii cytoskeletu.
Viz článek Wikipedia motor protein a motorické proteiny Kategorie Wikipedia.

helicase activityEdit

„katalýza odvíjení dna nebo RNA duplexu.,“

  • dnaB
  • recQ

integrázy activityEdit

„Katalýzy integrace DNA, možná tím, že tvoří přechodné DNA-protein odkaz.“

antioxidační aktivitaedit

„inhibice reakcí vyvolaných dioxygenem (O2) nebo peroxidy. Antioxidant je obvykle účinný, protože může být sám o sobě snadněji oxidován než látka chráněná. Termín je často aplikován na složky, které mohou zachytit volné radikály, čímž se přeruší řetězová reakce, která obvykle vede k rozsáhlému biologickému poškození.,“

metabolismEdit

„procesy, které způsobují mnoho chemických změn v živých organismech, včetně anabolismu a katabolismu. Metabolické procesy obvykle transformují malé molekuly, ale také zahrnují makromolekulární procesy, jako je oprava a replikace DNA, a syntéza a degradace proteinů.“Všimněte si, že metabolické procesy nezahrnují jednotlivé funkce nebo procesy, jako jsou interakce protein-protein, protein-nukleové kyseliny, ani interakce receptoru a ligandu.,

makromolekulový metabolizmedit

chemické reakce zahrnující makromolekuly (velké molekuly včetně proteinů, nukleových kyselin a sacharidů). Viz také: # katabolismus.

ProteolysisEdit
  • Proteázy
    • Kategorie:ES 3.4
  • inhibitory Proteázy
    • Serin proteázy, inhibitory kategorie

aminokyseliny a deriváty metabolismEdit

„chemické reakce zahrnující aminokyseliny, organické kyseliny, které obsahují jednu nebo více aminokyselin substituentů, a sloučeniny odvozené od aminokyselin.,“

nucleobase, nukleosidů, nukleotidů a nukleových kyselin metabolismEdit

„chemické reakce zahrnující nukleobází, nukleosidů, nukleotidů a nukleových kyselin.“

biosynthesisEdit

„energie-vyžadující část metabolismu, ve kterém jednodušší látky jsou transformovány na ty složitější, jako v růstu a další biosyntetické procesy.,“

catabolismEdit

exact_synonym: „zhroucení“
exact_synonym: „degradace“
„Žádné metabolické proces zahrnující rozklad složitých látek na menší výrobky, včetně rozdělení sloučenin uhlíku s osvobozením energie pro buňku nebo organismus.“
Poznámka :použijte # metabolismus makromolekul (výše) pro bílkoviny, nukleové kyseliny a sacharidy.

kinázy activityEdit

„Katalýza přenosu fosfátové skupiny, obvykle z ATP na substrátové molekuly.,“

oxidoredukční activityEdit

„Katalýzy na oxidačně-redukční (redox) reakce, reverzibilní chemické reakci, při které se oxidační stav atomu nebo atomů v molekule je změněna. Jeden substrát působí jako dárce vodíku nebo elektronu a oxiduje se, zatímco druhý působí jako vodík nebo akceptor elektronů a snižuje se.“

transferase activityEdit

“ katalýza přenosu skupiny, např., methylová skupina, glykosyl skupiny, acyl skupiny, s obsahem fosforu, nebo jiných skupin z jedné sloučeniny (obecně považován za dárce) na jinou sloučeninu (obecně považován jako akceptor). Transferáza je systematický název pro jakýkoli enzym třídy EC 2.“

hydrolázy activityEdit

lyasy activityEdit

„Katalýzy štěpení C-C, C-O, C-N a další vazby jiným způsobem než hydrolýzou nebo oxidací, nebo naopak přidání skupiny na dvojnou vazbu., Liší se od ostatních enzymů tím, že dva substráty jsou zapojeny do jednoho směru reakce, ale pouze jeden v opačném směru. Při působení na jediný substrát je molekula eliminována, což vytváří buď novou dvojnou vazbu nebo nový kruh.“(EC:4)

aktivita izomerázyedit

“ katalýza geometrických nebo strukturních změn v jedné molekule. Isomeráza je systematický název pro jakýkoli enzym třídy EC 5.,“

ligázy activityEdit

„Katalýzy ligaci dvou látek, při současném porušení difosfátové vazby, obvykle v nukleosidových trifosfát. Ligáza je systematický název pro jakýkoli enzym třídy EC 6.“

enzymový regulátor aktivityedit

“ moduluje aktivitu enzymu.“
exact_synonym: „enzym modulátor“

signál snímače activityEdit

namespace: molecular_functiondef: „Zprostředkovává přenos signálu z vnějšku do vnitřku buňky jinými prostředky než zavedením signální molekuly do buňky.,“

strukturní molekula activityEdit

“ působení molekuly, která přispívá ke strukturní integritě komplexu nebo sestavy uvnitř nebo vně buňky.“

Cytoskeletedit

cytoskelet je složen z proteinových vláken v cytoplazmě.

  • Kategorie cytoskeletu Wikipedie.

extracelulární matrixEdit

„vrstvou skládající se převážně z bílkovin (zejména kolagen) a glykosaminoglykany (především jako proteoglykany), které tvoří list hlubších buněk, jako jsou endoteliální a epitelové buňky., Proteiny jsou vylučovány buňkami v okolí. Stejně jako v mnohobuněčných zvířatech, ale bez omezení.

bindingEdit

„selektivní, často stechiometrické interakce molekuly s jedním nebo více konkrétních míst na jiné molekuly.“Pro ligandy, které se vážou k signálu transdukce receptory, zvažte molekulární funkce pojem ‚receptor‘ (receptory, níže)

Receptor activityEdit

„Kombinace s extracelulární nebo intracelulární posel iniciovat změny v buněčné aktivity.“

Kategorie receptorů Wikipedie.,

protein bindingEdit

„Interakce selektivně s jakýkoliv protein nebo proteinový komplex (komplex dvou nebo více proteinů, které mohou zahrnovat i jiné neproteinové molekuly).“

lipid bindingEdit

„selektivně a nekovalentně interaguje s lipidem.“(GO:0008289)

  • Lipid transfer proteinů

mobilní motilityEdit

„Žádné procesu podílejí na řízený pohyb buněk.“
exact_synonym:“cell locomotion“
exact_synonym:“cell movement“ Poznámka: viz také # motor activity (výše) pro jiné proteiny podílející se na pohyblivosti buněk.,

membránový fusionEdit

“ spojení dvou lipidových dvojvrstvů za vzniku jediné membrány.“

cell communicationEdit

“ jakýkoli proces, který zprostředkovává interakce mezi buňkou a jejím okolím. Zahrnuje interakce, jako je signalizace nebo připojení mezi jednou buňkou a jinou buňkou, mezi buňkou a extracelulární matricí nebo mezi buňkou a jakýmkoli jiným aspektem jejího prostředí.“

regulace biologického procesuedit

“ jakýkoli proces, který moduluje frekvenci, rychlost nebo rozsah biologického procesu., Biologické procesy jsou regulovány mnoha způsoby; příklady zahrnují kontrolu genové exprese, modifikaci bílkovin nebo interakci s proteinovou nebo substrátovou molekulou.“

vývojeditovat

„biologický proces specificky zaměřené na vývoj organismu v průběhu času od počáteční condi (např. mnohobuněčných zvířat, ve věku dospělý nebo dospělý jednobuněčný organismus).“(‚vývojový proces‘).

buněčná diferenciaceedit

“ proces, při kterém jsou relativně nespecializované buňky, např., embryonální nebo regenerační buňky získávají specializované strukturální a/nebo funkční vlastnosti, které charakterizují buňky, tkáně nebo orgány zralého organismu nebo jinou relativně stabilní fázi životní historie organismu.“

reakce na stimuluedit

“ změna stavu nebo aktivity buňky nebo organismu (z hlediska pohybu, sekrece, produkce enzymů, genové exprese atd.) v důsledku vnímání podnětu.“

behaviorEdit

“ specifické účinky nebo reakce organismu v reakci na vnější nebo vnitřní podněty., Vzorovaná aktivita celého organismu způsobem závislým na nějaké kombinaci vnitřního stavu a vnějších podmínek tohoto organismu.“

mobilní adhesionEdit

„konkrétní aalting procesů v buňce tak, že jeho životně důležité funkce výrazně přestat, spíše než jednoduše zhoršující se postupně v průběhu času, což vyústí v buněčnou smrt.“

transportEdit

“ řízený pohyb látek (jako jsou makromolekuly, malé molekuly, ionty) do, mimo, uvnitř nebo mezi buňkami.,“

protein transporter activityEdit

“ umožňuje řízený pohyb proteinů do, mimo, uvnitř nebo mezi buňkami.“

Jaderné transportEdit
  • importin, jaderné dopravy, faktor 2 (NTF2), Běžel, exportin

ion transporter activityEdit

„Umožňuje cílený pohyb nabité atomy nebo malé nabité molekuly do, z, do nebo mezi buňkami.,“

kanál nebo pórů třídy transportní activityEdit

„Umožňuje rozptylu (energeticky nezávislý proces) průchodem přes transmembránové vodných pórů nebo kanál bez nosičem zprostředkovaný mechanismus. Nevykazují stereospecifičnost, ale mohou být specifické pro určitý molekulární druh nebo třídu molekul.“

dopravce activityEdit

přesné synonymum: „dopravce typu transporter“
„Katalýza přenosu určité látky nebo související skupinu látek, z jedné strany membrány na druhou.,“

permease activityEdit

„katalýza stereospecifického přenosu substrátu přes biologickou membránu.“

secretionEdit

“ regulované uvolňování látky buňkou nebo skupinou buněk.“

electron transporter activityEdit

“ umožňuje řízený pohyb elektronů do, mimo, uvnitř nebo mezi buňkami.“

elektronová dopravaedit

“ transport elektronů z dárce elektronu do akceptoru elektronů.,“(přenos elektronů)

patogenezedit

“ specifické procesy, které vytvářejí schopnost organismu způsobovat onemocnění v jiném.“
Všimněte si, že tento termín by neměl být používán k anotaci genových produktů, které se podílejí na hostitelské reakci na patogenezi. Měl by být použit pouze k anotaci těchto genových produktů, které se podílejí na tvorbě patogeneze samotným patogenem (virulence).

chaperon regulator activityEdit

“ moduluje aktivitu molekulárního chaperonu.,“

nukleová kyselina bindingEdit

“ selektivně interaguje s jakoukoli nukleovou kyselinou.“

transkripční regulátor activityEdit

„Hraje roli v regulaci transkripce; může se vázat na promotor nebo enhancer sekvence DNA, nebo v interakci s DNA-vázající transkripční faktor.,“
Kategorie:Transkripční faktory
Kategorie:Přepis coregulators; Přepis coregulators jako PELP-1; Coactivator (genetika)

extracelulární struktury organizace a biogenesisEdit

„shromáždění a uspořádání staveb v prostoru vnější nejvzdálenějších strukturu buňky. Pro buňky bez vnějších ochranných nebo vnějších zapouzdřovacích struktur se jedná o prostor mimo plazmatickou membránu a také pokrývá prostředí hostitelských buněk mimo intracelulární parazit.,“
exact_synonym: „extracelulární struktury organizace a biogeneze“

překlad regulátor activityEdit

„Jakákoli látka podílí na zahájení řízení, aktivace, udržování, represe nebo ukončení syntézu polypeptidu na ribozomu.“

Share

Napsat komentář

Vaše e-mailová adresa nebude zveřejněna. Vyžadované informace jsou označeny *