Elenco dei tipi di proteine

“Attività elementali, come la catalisi o il legame, che descrivono le azioni di un prodotto genetico a livello molecolare. Un dato prodotto genetico può presentare una o più funzioni molecolari.”
Nota: le prossime quattro categorie (sotto) sono categorie generali predefinite. Prova a trovare categorie funzionali più specifiche (più avanti) per le proteine rispetto a queste categorie generali.

processo fisiologicomodifica

“Quei processi specificamente pertinenti al funzionamento delle unità abitative integrate: cellule, tessuti, organi e organismi.”…,

processo biologicomodifica

“Un fenomeno segnato da cambiamenti che portano a un risultato particolare, mediato da uno o più prodotti genici.”

processo cellularemodifica

” Processi che vengono eseguiti a livello cellulare, ma non sono necessariamente limitati a una singola cella. Ad esempio, la comunicazione cellulare avviene tra più di una cella, ma avviene a livello cellulare.”

cellular physiological processEdit

” I processi pertinenti alla funzione integrata di una cellula.,”

attività cataliticamodifica

related_synonym:”Attività enzimatica”
” Catalisi di una reazione biochimica a temperature fisiologiche. Nelle reazioni biologicamente catalizzate, i reagenti sono noti come substrati e i catalizzatori sono sostanze macromolecolari presenti in natura note come enzimi. Gli enzimi possiedono siti di legame specifici per i substrati e di solito sono composti interamente o in gran parte di proteine, ma l’RNA che ha attività catalitica (ribozima) è spesso considerato anche enzimatico.”
Nota: vedi la categoria degli enzimi di Wikipedia.,

Attività dell’aromatasamodifica

  • Vedere la categoria Wikipedia EC 1.14.14.

attività motoremodifica

Catalisi del movimento lungo una molecola polimerica come un microfilamento o un microtubulo, accoppiato all’idrolisi di un trifosfato nucleosidico. Include anche motori procarioti.
Nota: le proteine motorie miosina, chinesina e dynein sono anche nella categoria del citoscheletro.
Vedi l’articolo di Wikipedia Motor protein e la categoria motor proteins di Wikipedia.

helicase activityEdit

“Catalisi dello svolgimento di un DNA o RNA duplex.,”

  • dnaB
  • recQ

integrasi activityEdit

” Catalisi dell’integrazione del DNA possibilmente formando un legame DNA-proteina transitorio.”

attività antiossidante

” Inibizione delle reazioni provocate dal diossigeno (O2) o dai perossidi. Di solito l’antiossidante è efficace perché può essere più facilmente ossidato rispetto alla sostanza protetta. Il termine è spesso applicato a componenti che possono intrappolare i radicali liberi, rompendo così la reazione a catena che normalmente porta a danni biologici estesi.,”

metabolismOdit

“Processi che causano molti dei cambiamenti chimici negli organismi viventi, tra cui l’anabolismo e il catabolismo. I processi metabolici in genere trasformano piccole molecole, ma includono anche processi macromolecolari come la riparazione e la replicazione del DNA e la sintesi e la degradazione delle proteine.”Si noti che i processi metabolici non includono singole funzioni o processi come interazioni proteina-proteina, acidi proteina-nucleici, né interazioni recettore-ligando.,

Metabolismo delle macromolecolemodifica

Le reazioni chimiche che coinvolgono macromolecole (grandi molecole tra cui proteine, acidi nucleici e carboidrati). Vedi anche: # catabolismo.

ProteolysisEdit
  • Proteasi
    • Categoria:CE 3.4
  • inibitori della Proteasi
    • gli inibitori della proteasi Serina categoria

aminoacidi e derivati metabolismEdit

“Le reazioni chimiche che coinvolgono aminoacidi, acidi organici contenenti uno o più aminoacidi sostituenti, e composti derivati da amminoacidi.,”

nucleobasi, nucleosidi, nucleotidi e acidi nucleicimodifica

” Le reazioni chimiche che coinvolgono nucleobasi, nucleosidi, nucleotidi e acidi nucleici.”

biosintesi

” La parte che richiede energia del metabolismo in cui le sostanze più semplici vengono trasformate in quelle più complesse, come nella crescita e in altri processi biosintetici.,”

catabolismEdit

exact_synonym:”breakdown “
exact_synonym:”degradation”
” Qualsiasi processo metabolico che comporta la scomposizione di sostanze complesse in prodotti più piccoli, compresa la scomposizione di composti del carbonio con la liberazione di energia per l’uso da parte della cellula o dell’organismo.”
Nota: usa il metabolismo delle macromolecole (sopra) per proteine, acidi nucleici e carboidrati.

Attività chinasicamodifica

“Catalisi del trasferimento di un gruppo fosfato, di solito da ATP, a una molecola di substrato.,”

ossidoreduttasi activityEdit

” Catalisi di una reazione redox (redox); una reazione chimica reversibile in cui lo stato di ossidazione di un atomo o atomi all’interno di una molecola è alterato. Un substrato agisce come donatore di idrogeno o di elettroni e diventa ossidato, mentre l’altro agisce come accettore di idrogeno o di elettroni e si riduce.”

attività della transferasamodifica

” Catalisi del trasferimento di un gruppo, ad es., un gruppo metilico, gruppo glicosilico, gruppo acilico, contenenti fosforo, o altri gruppi, da un composto (generalmente considerato come il donatore) ad un altro composto (generalmente considerato come l’accettore). Transferasi è il nome sistematico per qualsiasi enzima di classe EC 2.”

hydrolase activityEdit

lyase activityEdit

” Catalisi della scissione di C-C, C-O, C-N e altri legami con mezzi diversi dall’idrolisi o dall’ossidazione, o viceversa aggiungendo un gruppo a un doppio legame., Differiscono da altri enzimi in quanto due substrati sono coinvolti in una direzione di reazione, ma solo uno nell’altra direzione. Quando agisce sul singolo substrato, una molecola viene eliminata e questo genera un nuovo doppio legame o un nuovo anello.”(EC: 4)

isomerase activityEdit

“Catalisi dei cambiamenti geometrici o strutturali all’interno di una molecola. Isomerasi è il nome sistematico per qualsiasi enzima di classe EC 5.,”

attività della ligasiamodifica

” Catalisi della legatura di due sostanze con rottura concomitante di un legame difosfato, di solito in un trifosfato nucleosidico. Ligasi è il nome sistematico per qualsiasi enzima di classe EC 6.”

enzyme regulator activityEdit

” Modula l’attività di un enzima.”
exact_synonym:”enzyme modulator “

signal transducer activityEdit

namespace: molecular_functiondef: “Media il trasferimento di un segnale dall’esterno all’interno di una cellula con mezzi diversi dall’introduzione della molecola del segnale stesso nella cellula.,”

structural molecule activityEdit

” L’azione di una molecola che contribuisce all’integrità strutturale di un complesso o di un assemblaggio all’interno o all’esterno di una cellula.”

Citoscheletro

Il citoscheletro è composto da filamenti proteici nel citoplasma.

  • La categoria Citoscheletro di Wikipedia.

matrixEdit extracellulare

“Uno strato costituito principalmente da proteine (in particolare collagene) e glicosaminoglicani (principalmente come proteoglicani) che forma un foglio sottostante cellule come cellule endoteliali ed epiteliali., Le proteine sono secrete dalle cellule nelle vicinanze. Come in, ma non limitato a, gli animali multicellulari.

bindingEdit

“L’interazione selettiva, spesso stechiometrica di una molecola con uno o più siti specifici su un’altra molecola.”Per i ligandi che si legano ai recettori di trasduzione del segnale, considerare il termine di funzione molecolare ‘recettore vincolante’ (attività del recettore, sotto)

Attività del recettoreedit

“Combinandosi con un messaggero extracellulare o intracellulare per avviare un cambiamento nell’attività cellulare.”

La categoria dei recettori di Wikipedia.,

legame proteicomodifica

“Interagendo selettivamente con qualsiasi proteina o complesso proteico (un complesso di due o più proteine che possono includere altre molecole non proteiche).”

lipid bindingEdit

” Interagendo selettivamente e non covalentemente con un lipido.”(GO:0008289)

  • Lipid transfer proteins

cell motilityEdit

” Qualsiasi processo coinvolto nel movimento controllato di una cellula.”
exact_synonym:”locomozione cellulare”
exact_synonym:”movimento cellulare” Nota: vedi anche #attività motoria (sopra) per altre proteine coinvolte nella motilità cellulare.,

membrana fusionEdit

“L’unione di due doppi strati lipidici per formare un’unica membrana.”

cell communicationEdit

” Qualsiasi processo che media le interazioni tra una cellula e l’ambiente circostante. Comprende interazioni come la segnalazione o l’attaccamento tra una cellula e un’altra cellula, tra una cellula e una matrice extracellulare o tra una cellula e qualsiasi altro aspetto del suo ambiente.”

regolazione del processo biologicomodifica

” Qualsiasi processo che modula la frequenza, la velocità o l’estensione di un processo biologico., I processi biologici sono regolati da molti mezzi; esempi includono il controllo dell’espressione genica, la modificazione proteica o l’interazione con una molecola di proteina o substrato.”

Sviluppomodifica

” Il processo biologico mirava specificamente alla progressione di un organismo nel tempo da un condi iniziale (ad esempio un animale multicellulare, un adulto invecchiato o un organismo unicellulare maturo).”(“processo di sviluppo”).

differenziazione delle cellulemodifica

” Il processo per cui cellule relativamente non specializzate, ad esempio, cellule embrionali o rigenerative, acquisiscono caratteristiche strutturali e/o funzionali specializzate che caratterizzano le cellule, i tessuti o gli organi dell’organismo maturo o qualche altra fase relativamente stabile della storia della vita dell’organismo.”

risposta allo stimolomodifica

“Un cambiamento nello stato o nell’attività di una cellula o di un organismo (in termini di movimento, secrezione, produzione enzimatica, espressione genica, ecc.) come risultato della percezione di uno stimolo.”

Comportamentomodifica

“Le azioni o le reazioni specifiche di un organismo in risposta a stimoli esterni o interni., Attività modellata di un intero organismo in un modo dipendente da una combinazione dello stato interno di quell’organismo e delle condizioni esterne.”

adesione cellularemodifica

” L’aalting specifico dei processi all’interno di una cellula in modo che le sue funzioni vitali cessino marcatamente, piuttosto che semplicemente deteriorarsi gradualmente nel tempo, che culmina nella morte cellulare.”

transportEdit

“Il movimento diretto di sostanze (come macromolecole, piccole molecole, ioni) in, fuori, all’interno o tra le cellule.,”

protein transporter activityEdit

” Consente il movimento diretto delle proteine dentro, fuori, all’interno o tra le cellule.”

Nuclear transportEdit
  • importin, nuclear transport factor 2 (NTF2), Ran, exportin

ion transporter activityEdit

” Consente il movimento diretto di atomi o piccole molecole cariche dentro, fuori, all’interno o tra le cellule.,”

channel or pore class transporter activityEdit

” Consente una diffusione facilitata (mediante un processo indipendente dall’energia) mediante passaggio attraverso un poro o un canale acquoso transmembrana senza un meccanismo mediato dal vettore. Non presentano stereospecificità ma possono essere specifici per una particolare specie molecolare o classe di molecole.”

carrier activityEdit

sinonimo esatto:”carrier type transporter”
” Catalisi del trasferimento di una sostanza specifica o di un gruppo correlato di sostanze da un lato della membrana all’altro.,”

permease activityEdit

” Catalisi del trasferimento stereospecifico di un substrato attraverso una membrana biologica.”

secretionEdit

” Il rilascio regolato di una sostanza da parte di una cellula o di un gruppo di cellule.”

electron transporter activityEdit

” Consente il movimento diretto degli elettroni in, fuori, all’interno o tra le cellule.”

electron transportEdit

” Il trasporto di elettroni da un donatore di elettroni ad un accettore di elettroni.,”(trasferimento di elettroni)

Patogenesimodifica

” I processi specifici che generano la capacità di un organismo di causare malattie in un altro.”
Si noti che questo termine non dovrebbe essere usato per annotare i prodotti genici che sono coinvolti nella risposta dell’ospite alla patogenesi. Deve essere usato solo per annotare quei prodotti genetici coinvolti nella generazione della patogenesi da parte del patogeno stesso (virulenza).

chaperone regulator activityEdit

“Modula l’attività di un chaperone molecolare.,”

nucleic acid bindingEdit

” Interagendo selettivamente con qualsiasi acido nucleico.”

transcription regulator activityEdit

” Svolge un ruolo nella regolazione della trascrizione; può legare una sequenza di DNA del promotore o del potenziatore o interagire con un fattore di trascrizione legante il DNA.,”
Categoria:Fattori di trascrizione
Categoria:coregulatori di trascrizione; coregulatori di trascrizione come PELP-1; Coactivator (genetics)

organizzazione della struttura extracellulare e biogenesisEdit

” L’assemblaggio e la disposizione delle strutture nello spazio esterno alla struttura più esterna di una cellula. Per le cellule senza strutture incapsulanti esterne o protettive esterne questo si riferisce allo spazio al di fuori della membrana plasmatica e copre anche l’ambiente della cellula ospite al di fuori di un parassita intracellulare.,”
exact_synonym:”extracellular structure organization and biogenesis”

translation regulator activityEdit

” Qualsiasi sostanza coinvolta nell’iniziazione, attivazione, perpetuazione, repressione o cessazione della sintesi polipeptidica al ribosoma.”

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