el microbioma humano es la colección de todos los microorganismos que viven en asociación con el cuerpo humano. Estas comunidades incluyen eucariotas, arqueas, bacterias y virus. Las bacterias en un cuerpo humano promedio son diez veces más que las células humanas, para un total de aproximadamente 1000 genes más que los que están presentes en el genoma humano. Sin embargo, debido a su pequeño tamaño, los microorganismos representan solo entre el 1 y el 3 por ciento de nuestra masa corporal (es decir, entre 2 y 6 libras de bacterias en un ADULTO de 200 libras)., Estos microbios generalmente no son dañinos para nosotros, de hecho, son esenciales para mantener la salud. Por ejemplo, producen ciertas vitaminas que no tenemos los genes para hacer, descomponen nuestros alimentos para extraer los nutrientes que necesitamos para sobrevivir, enseñan a nuestros sistemas inmunológicos cómo reconocer invasores peligrosos e incluso producen compuestos antiinflamatorios útiles que combaten otros microbios que causan enfermedades., Un número cada vez mayor de estudios han demostrado que los cambios en la composición de nuestros microbiomas se correlacionan con numerosos estados de enfermedad, lo que plantea la posibilidad de que la manipulación de estas comunidades se pueda utilizar para tratar la enfermedad.
El Proyecto de Microbioma Humano (HMP) fue apoyado por el Fondo Común de los Institutos Nacionales de salud (NIH) desde 2007 hasta 2016, con la misión de generar recursos que permitan la caracterización integral del microbioma humano y el análisis de su papel en la salud humana y la enfermedad., Esta área del sitio web se centra en el primero de un esfuerzo de dos fases, frecuentemente denominado HMP1, que se desarrolló desde 2008 hasta 2013. Desde el sitio web del Fondo Común:
El Proyecto de Microbioma Humano ha pasado del apoyo del Fondo Común. Los programas de fondos comunes son inversiones estratégicas que logran un conjunto de objetivos de alto impacto dentro de un plazo de 5 a 10 años. Al concluir cada programa, los entregables pasan a otras fuentes de apoyo o uso por parte de la comunidad científica en general. El HMP fue apoyado por el Fondo Común de 2007 a 2016., La inversión no-HMP en investigación de microbiomas en los NIH ha aumentado más de cuarenta veces desde el inicio del HMP y abarca más de 20 de los institutos y centros de los NIH. Tenga en cuenta que, dado que el HMP ya no cuenta con el apoyo del Fondo Común, el sitio web del programa se mantiene como archivo y no se actualizará periódicamente.
la microbiología tradicional se ha centrado históricamente en el estudio de especies individuales como unidades aisladas., Sin embargo, la gran mayoría de las especies microbianas nunca han sido aisladas con éxito como especímenes viables para análisis, presumiblemente porque su crecimiento depende de un microambiente específico que no ha sido, o no puede ser, reproducido experimentalmente. Los avances en las tecnologías de secuenciación del ADN a mediados de la década de 2000 contribuyeron a la creación de un nuevo campo de investigación, llamado metagenómica, que permite el examen exhaustivo de las comunidades microbianas sin necesidad de cultivo., En lugar de examinar el genoma de una cepa bacteriana individual que se ha cultivado en un laboratorio, el enfoque metagenómico examina la colección de genomas derivados de comunidades microbianas muestreadas de entornos naturales. En HMP1, los métodos metagenómicos complementaron los análisis genómicos de cepas aisladas conocidas, proporcionando información sin precedentes sobre la complejidad de las comunidades microbianas humanas.,
HMP1 caracterizó las comunidades microbianas que se encuentran en varios sitios diferentes en el cuerpo humano: conductos nasales, cavidad oral, piel, tracto gastrointestinal y tracto urogenital, y examinó el papel de estos microbios en la salud humana y la enfermedad. Los 5 objetivos declarados del proyecto fueron el desarrollo de un conjunto de referencia de 3.000 secuencias de genoma microbiano aisladas. En el transcurso del proyecto, 3.055 genomas aislados del cuerpo humano fueron secuenciados a borrador o estado completo. Obtenga más información sobre los esfuerzos de secuenciación del genoma de referencia, incluido el acceso a metadatos.,
HMP1 fue un esfuerzo interdisciplinario que comprendió cuatro centros de secuenciación (The Broad Institute, Baylor College Of Medicine, Washington University School Of Medicine, y The J., Craig Venter Institute), un centro de análisis y coordinación de datos (DACC), y varios investigadores independientes involucrados en proyectos de demostración que analizan más de cerca las asociaciones entre el microbioma y la salud y la enfermedad humanas, el desarrollo de herramientas y tecnología, y la identificación de implicaciones éticas. Ver la membresía completa del consorcio.