” elementaire activiteiten, zoals katalyse of binding, die de werking van een genproduct op moleculair niveau beschrijven. Een bepaald genproduct kan een of meer moleculaire functies vertonen.”
opmerking: de volgende vier categorieën (hieronder) zijn algemene standaardcategorieën. Probeer meer specifieke functionele categorieën (verder hieronder) voor proteã nen te vinden dan deze algemene categorieën.
fysiologische procededit
” deze processen die specifiek relevant zijn voor het functioneren van geïntegreerde levende eenheden: cellen, weefsels, organen en organismen.”…,
biological processEdit
” een fenomeen gekenmerkt door veranderingen die leiden tot een bepaald resultaat, gemedieerd door een of meer genproducten.”
cellulaire processEdit
“processen die op cellulair niveau worden uitgevoerd, maar niet noodzakelijk beperkt zijn tot één enkele cel. Bijvoorbeeld, komt de celcommunicatie onder meer dan één cel voor, maar komt op cellulair niveau voor.”
cellulair fysiologisch procededit
” de processen die relevant zijn voor de geïntegreerde functie van een cel.,”
katalytische activiteitedit
related_synoniem:”enzymactiviteit”
” katalyse van een biochemische reactie bij fysiologische temperaturen. In biologisch gekatalyseerde reacties, zijn de reactanten bekend als substraten, en de katalysatoren zijn natuurlijk voorkomende macromoleculaire substanties bekend als enzymen. De enzymen bezitten specifieke bandplaatsen voor substraten, en zijn gewoonlijk geheel of grotendeels samengesteld uit proteã ne, maar RNA dat katalytische activiteit (ribozyme) heeft wordt vaak ook beschouwd als enzymatisch.”
opmerking: Zie de Wikipedia enzymen categorie.,
aromatase activityEdit
- zie de Wikipedia EC 1.14.14 categorie.
motorische activiteitedit
katalyse van beweging langs een polymere molecule zoals een microfilament of microtubule, gekoppeld aan de hydrolyse van een nucleoside trifosfaat. Omvat ook prokaryotische motoren.Opmerking: De myosine -, kinesine-en dyneinmotoreiwitten behoren ook tot de cytoskeletcategorie.zie het artikel over Motorproteïnen van Wikipedia en de categorie motorproteïnen van Wikipedia.
helicase activityEdit
” katalyse van het afwikkelen van een DNA-of RNA-duplex.,”
- dnaB
- recQ
integrase activityEdit
” katalyse van de integratie van DNA mogelijk door het vormen van een transiënte DNA-eiwitverbinding.”
antioxidant activityEdit
” remming van de reacties veroorzaakt door dioxygen (O2) of peroxiden. Meestal is de antioxidant effectief omdat het zelf gemakkelijker geoxideerd kan worden dan de stof beschermd. De term wordt vaak toegepast op componenten die vrije radicalen kunnen vangen, waardoor de kettingreactie wordt verbroken die normaal gesproken leidt tot uitgebreide biologische schade.,”
metabolismEdit
” processen die veel van de chemische veranderingen in levende organismen veroorzaken, waaronder anabolisme en katabolisme. De metabolische processen transformeren typisch kleine molecules, maar omvatten ook macromoleculaire processen zoals de reparatie en replicatie van DNA, en eiwitsynthese en degradatie.”Merk op dat metabolische processen geen enkele functies of processen zoals eiwit-eiwitinteracties, eiwit-nucleïnezuren, noch receptor-ligandinteracties omvatten.,
macromolecuulmetabolisme
de chemische reacties waarbij macromoleculen betrokken zijn (grote moleculen waaronder eiwitten, nucleïnezuren en koolhydraten). Zie ook: # katabolisme.
ProteolysisEdit
- Protease
- categorie:EC 3.4
- proteaseremmers
- Serine proteaseremmers categorie
aminozuur en derivaatmetabolisme
“de chemische reacties waarbij aminozuren betrokken zijn, organische zuren die één of meer aminosubstituenten bevatten, en verbindingen afgeleid van aminozuren.,”
nucleobase, nucleoside, nucleotide and nucleic acid metabolismEdit
“de chemische reacties waarbij nucleobasen, nucleosiden, nucleotiden en nucleïnezuren betrokken zijn.”
biosynthesedit
” het energievereisende deel van het metabolisme waarin eenvoudigere stoffen worden omgezet in complexere stoffen, zoals in groei en andere biosynthetische processen.,”
catabolismEdit
exact_synonym: “breakdown”
exact_synonym:”degradation”
” elk metabolisch proces waarbij complexe stoffen worden afgebroken tot kleinere producten, met inbegrip van de afbraak van koolstofverbindingen met het vrijkomen van energie voor gebruik door de cel of het organisme.NB: gebruik #macromoleculenmetabolisme (hierboven) voor eiwitten, nucleïnezuren en koolhydraten.
kinase activityEdit
” katalyse van de transfer van een fosfaatgroep, gewoonlijk van ATP, naar een substraatmolecuul.,”
oxidoreductase activityEdit
” Catalysis of an oxidation-reduction (redox) reaction; a reversible chemical reaction in which the oxidation state of an atom or atoms in a molecule is changed. Het ene substraat doet dienst als waterstof of elektronendonor en wordt geoxideerd, terwijl het andere als waterstof of elektronenacceptor dienst doet en wordt verminderd.”
transferase activityEdit
” katalyse van de overdracht van een groep, bijv., een methylgroep, glycosylgroep, acylgroep, fosfor bevattende of andere groepen, van de ene verbinding (algemeen beschouwd als donor) naar een andere verbinding (algemeen beschouwd als acceptor). Transferase is de systematische naam voor elk enzym van EG-klasse 2.”
hydrolaseactivityedit
lyase activityEdit
“katalyse van de splitsing van C-C, C-O, C-N en andere bindingen op andere wijze dan door hydrolyse of oxidatie, of omgekeerd het toevoegen van een groep aan een dubbele binding., Ze verschillen van andere enzymen in die zin dat twee substraten betrokken zijn in één reactierichting, maar slechts één in de andere richting. Wanneer het handelen op het enige substraat, wordt een molecuul geëlimineerd en dit produceert of een nieuwe dubbele band of een nieuwe ring.”(EC:4)
isomerase activityEdit
“katalyse van de geometrische of structurele veranderingen binnen één molecuul. Isomerase is de systematische naam voor om het even welk enzym van EG-Klasse 5.,”
ligase activityEdit
” katalyse van de ligatie van twee stoffen met gelijktijdig breken van een difosfaatverbinding, meestal in een nucleoside trifosfaat. Ligase is de systematische naam voor om het even welk enzym van EG-klasse 6.”
enzymregulator activityEdit
“moduleert de activiteit van een enzym.”
exact_synonym:”enzyme modulator “
signal transducer activityEdit
namespace: molecular_functiondef: “Mediates the transfer of a signal from the outside to the inside of a cell by Medien not the introduction of the signal molecule its Into the cell.,”
structural molecule activityEdit
“de werking van een molecuul dat bijdraagt tot de structurele integriteit van een complex of samenstel binnen of buiten een cel.”
CytoskeletonEdit
het cytoskelet bestaat uit eiwitvezels in het cytoplasma.
- De Wikipedia cytoskelet categorie.
extracellulaire matrixEdit
“een laag die voornamelijk bestaat uit eiwitten (vooral collageen) en glycosaminoglycanen (meestal als proteoglycanen) die een onderliggend blad vormen, zoals endotheliale en epitheliale cellen., De proteã nen worden afgescheiden door cellen in de nabijheid. Zoals in, maar niet beperkt tot, de meercellige dieren.
bindedit
” de selectieve, vaak stoichiometrische interactie van een molecuul met een of meer specifieke plaatsen op een ander molecuul.”Voor liganden die zich binden aan signaaltransducerende receptoren, overweeg dan de moleculaire functieterm ‘receptor binding’ (receptor activiteit, hieronder)
Receptor activityEdit
” gecombineerd met een extracellulaire of intracellulaire boodschapper om een verandering in de celactiviteit in gang te zetten.”
De Wikipedia receptoren categorie.,
eiwitbindedit
” een selectieve interactie met een eiwit of eiwitcomplex (een complex van twee of meer eiwitten die andere niet-proteïnemoleculen kunnen bevatten).”
lipid bindinedit
“een selectieve en niet-covalente interactie met een lipide.”(GO: 0008289)
- lipide transfer proteins
cell motilityEdit
“elk proces dat betrokken is bij de gecontroleerde beweging van een cel.”
exact_synonym:”cell locomotion”
exact_synonym:”cell movement” opmerking: Zie ook #motorische activiteit (hierboven) voor andere eiwitten die betrokken zijn bij celmotiliteit.,
membraanfusionedit
” het samenvoegen van twee lipide bilagen tot één enkel membraan.”
cell communicationEdit
” elk proces dat interacties tussen een cel en zijn omgeving bemiddelt. Omvat interactie zoals het signaleren of gehechtheid tussen één cel en een andere cel, tussen een cel en een extracellulaire matrijs, of tussen een cel en een ander aspect van zijn milieu.”
regulation of biological processEdit
“elk proces dat de frequentie, snelheid of omvang van een biologisch proces moduleert., De biologische processen worden geregeld door vele middelen; voorbeelden omvatten de controle van genuitdrukking, eiwitmodificatie of interactie met een proteã ne of substraatmolecuul.”
ontwikkelingsedit
“het biologische proces dat specifiek gericht is op de progressie van een organisme in de loop van de tijd vanaf een initiële condiditie (bijvoorbeeld een meercellig dier, een volwassen of een volwassen eencellig organisme).”(‘ontwikkelingsproces’).
celdifferentiatiedit
“het proces waarbij relatief ongespecialiseerde cellen, bijv., embryonale of regeneratieve cellen, verwerven gespecialiseerde structurele en / of functionele kenmerken die de cellen, weefsels, of organen van het volwassen organisme of een andere relatief stabiele fase van de levensgeschiedenis van het organisme kenmerken.”
respons op stimulusEdit
” een verandering in de toestand of activiteit van een cel of organisme (in termen van beweging, secretie, enzymproductie, genexpressie, enz.) als gevolg van de perceptie van een stimulus.”
behaviorEdit
“de specifieke acties of reacties van een organisme in reactie op externe of interne stimuli., Patroon activiteit van een heel organisme op een manier afhankelijk van een combinatie van de interne toestand van dat organisme en externe voorwaarden.”
cell adhesionEdit
” de specifieke aalting van processen binnen een cel, zodat zijn vitale functies duidelijk ophouden, in plaats van gewoon geleidelijk af te nemen in de tijd, die culmineert in celdood.”
transportEdit
” de gerichte beweging van stoffen (zoals macromoleculen, kleine moleculen, ionen) naar, uit, binnen of tussen cellen.,”
protein transporter activityEdit
“maakt de gerichte beweging van eiwitten in, uit, binnen of tussen cellen mogelijk.”
Nuclear transportEdit
- importine, nuclear transport factor 2 (NTF2), Ran, exportin
ion transporter activityEdit
“maakt de gerichte beweging van geladen atomen of kleine geladen moleculen in, uit, binnen of tussen cellen mogelijk.,”
transporteractiviteitedit
” maakt een gefaciliteerde diffusie mogelijk (door een energieonafhankelijk proces) door passage door een transmembraanwaterige porie of kanaal zonder een dragergemedieerd mechanisme. Ze vertonen geen stereospecificiteit, maar kunnen specifiek zijn voor een bepaalde moleculaire soort of klasse van moleculen.”
carrier activityEdit
exact synoniem: “carrier Type transporter”
” katalyse van de overdracht van een specifieke stof of verwante groep stoffen van de ene kant van het membraan naar de andere.,”
permease activityEdit
” katalyse van de stereospecifieke overdracht van een substraat over een biologisch membraan.”
secretiedit
” de gereguleerde afgifte van een stof door een cel of groep cellen.”
electron transporter activityEdit
” maakt de gerichte beweging van elektronen in, uit, binnen of tussen cellen mogelijk.”
elektronentransportedit
” het transport van elektronen van een elektronendonor naar een elektronenacceptor.,”(electron transfer)
pathogenesisEdit
” de specifieke processen die het vermogen van een organisme om ziekte in een ander te veroorzaken genereren.”
merk op dat deze term niet gebruikt mag worden om genproducten te annoteren die betrokken zijn bij de reactie van de gastheer op pathogenese. Het zou slechts moeten worden gebruikt om die genproducten te annoteren betrokken bij de generatie van pathogenese door de ziekteverwekker zelf (virulentie).
chaperonregulator activiteitedit
” moduleert de activiteit van een moleculaire Chaperon.,”
nucleïnezuurbindendedit
” een selectieve interactie met enig nucleïnezuur.”
transcriptieregulator activityEdit
“speelt een rol bij het reguleren van de transcriptie; kan een DNA-sequentie van een promotor of versterker binden of interageren met een DNA-bindende transcriptiefactor.,”
Category: Transcription factors
Category: Transcription coregulators; Transcription coregulators like PELP-1; Coactivator (genetics)
extracellular structure organization and biogenesisEdit
” The assembly and arrangement of structures in the space external to the outer structure of a cell. Voor cellen zonder externe beschermende of externe inkapselingsstructuren verwijst dit naar ruimte buiten het plasmamembraan, en behandelt ook het milieu van de gastheercel buiten een intracellular parasiet.,”
exact_synonym:”extracellular structure organization and biogenesis”
translation regulator activityEdit
” elke stof die betrokken is bij de initiatie, activering, bestendiging, onderdrukking of beëindiging van polypeptidesynthese bij het ribosoom.”