”elementära aktiviteter, såsom katalys eller bindning, som beskriver verkan av en genprodukt på molekylär nivå. En given genprodukt kan uppvisa en eller flera molekylära funktioner.”
Obs! de följande fyra kategorierna (nedan) är allmänna standardkategorier. Försök att hitta mer specifika funktionella kategorier (nedan) för proteiner än dessa allmänna kategorier.
fysiologisk processEdit
”de processer som är specifikt relevanta för funktionen av integrerade levande enheter: celler, vävnader, organ och organismer.”…,
biologisk processEdit
”ett fenomen som kännetecknas av förändringar som leder till ett visst resultat, medierad av en eller flera genprodukter.”
cellular processEdit
” processer som utförs på cellulär nivå, men är inte nödvändigtvis begränsade till en enda cell. Cellkommunikation sker till exempel bland mer än en cell, men förekommer på cellulär nivå.”
cellulär fysiologisk processEdit
” processerna som är relevanta för en Cells integrerade funktion.,”
katalytisk aktivitetetedit
related_synonym:”enzymaktivitet”
” katalys av en biokemisk reaktion vid fysiologiska temperaturer. I biologiskt katalyserade reaktioner är reaktanterna kända som substrat, och katalysatorerna är naturligt förekommande makromolekylära ämnen som kallas enzymer. Enzymer har specifika bindningsställen för substrat och består vanligtvis helt eller till stor del av protein, men RNA som har katalytisk aktivitet (ribozym) betraktas ofta också som enzymatisk.”
Obs: se Wikipedia enzymer kategori.,
aromatasaktivitedit
- se Wikipedia EC 1.14.14 kategori.
motoraktivitedit
katalys av rörelse längs en polymermolekyl, såsom en mikrofilament eller mikrotubul, kopplad till hydrolysen av ett nukleosidtrifosfat. Inkluderar även prokaryota motorer.
Obs! myosin -, kinesin-och dyneinmotorproteinerna finns också i cytoskelettkategorin.
se Wikipedia Motor protein artikeln och motor proteiner Kategori Wikipedia.
helicase activityEdit
”katalys av avvecklingen av ett DNA eller RNA duplex.,”
- dnaB
- recQ
integrase activityEdit
”katalys av integrationen av DNA eventuellt genom att bilda en övergående DNA-proteinlänk.”
antioxidant activityEdit
” hämning av reaktionerna som orsakas av dioxygen (O2) eller peroxider. Vanligtvis är antioxidanten effektiv eftersom den i sig lättare kan oxideras än ämnet skyddat. Termen appliceras ofta på komponenter som kan fånga fria radikaler och därigenom bryta kedjereaktionen som normalt leder till omfattande biologisk skada.,”
metabolismEdit
” processer som orsakar många av de kemiska förändringarna i levande organismer, inklusive anabolism och katabolism. Metaboliska processer omvandlar vanligtvis små molekyler, men inkluderar även makromolekylära processer som DNA-reparation och replikation och proteinsyntes och nedbrytning.”Observera att metaboliska processer inte innehåller enskilda funktioner eller processer som protein-proteininteraktioner, protein-nukleinsyror eller receptor-ligand-interaktioner.,
makromolekylmetabolismedit
de kemiska reaktionerna som involverar makromolekyler (stora molekyler inklusive proteiner, nukleinsyror och kolhydrater). Se även: # katabolism.
Proteolysedit
- proteas
- Kategori: EC 3.4
- proteashämmare
- Serinproteashämmare kategori
aminosyra och derivatmetabolismedit
” de kemiska reaktionerna som involverar aminosyror, organiska syror som innehåller en eller flera aminosubstituenter och föreningar som härrör från aminosyror.syror.,”
nukleobas, nukleosid, nukleotid och nukleinsyrametabolismedit
” de kemiska reaktionerna som involverar nukleobaser, nukleosider, nukleotider och nukleinsyror.”
biosyntesedit
” den energikrävande delen av ämnesomsättningen där enklare ämnen omvandlas till mer komplexa, som i tillväxt och andra biosyntetiska processer.,”
katabolismedit
exact_synonym:”breakdown ”
exact_synonym:”degradering”
” varje metabolisk process som involverar nedbrytning av komplexa ämnen i mindre produkter, inklusive nedbrytning av kolföreningar med befrielsen av energi för användning av cellen eller organismen.”
Obs: Använd # makromolekylmetabolism (ovan) för proteiner, nukleinsyror och kolhydrater.
kinasaktivitedit
”katalys av överföringen av en fosfatgrupp, vanligtvis från ATP, till en substratmolekyl.,”
oxidoreduktasaktivitedit
” katalys av en oxidationsreduceringsreaktion (redox); en reversibel kemisk reaktion där oxidationstillståndet hos en atom eller atomer inom en molekyl förändras. Ett substrat fungerar som väte-eller elektrondonator och oxideras, medan den andra fungerar som väte-eller elektronacceptor och blir reducerad.”
överföringsaktivitedit
” katalys av överföringen av en grupp, t. ex., en metylgrupp, glykosylgrupp, acylgrupp, fosforhaltiga eller andra grupper, från en förening (allmänt betraktad som donator) till en annan förening (allmänt betraktad som acceptor). Transferas är det systematiska namnet för något enzym i EG-klass 2.”
hydrolasaktivitedit
lyasaktivitedit
” katalys av klyvning av c-c, c-o, c-n och andra bindningar på annat sätt än genom hydrolys eller oxidation, eller omvänt lägga till en grupp i en dubbelbindning., De skiljer sig från andra enzymer genom att två substrat är involverade i en Reaktionsriktning, men bara en i andra riktningen. När det verkar på det enda substratet elimineras en molekyl och detta genererar antingen en ny dubbelbindning eller en ny ring.”(EC:4)
isomeras activityEdit
” katalys av geometriska eller strukturella förändringar inom en molekyl. Isomeras är det systematiska namnet för något enzym i EG-Klass 5.,”
ligasaktivitedit
” katalys av ligering av två ämnen med samtidig brytning av en difosfatbindning, vanligtvis i en nukleosidtrifosfat. Ligas är det systematiska namnet för något enzym i EG-klass 6.”
enzymregulatoraktivitetedit
” modulerar aktiviteten hos ett enzym.”
exact_synonym:”enzymmodulator ”
signaltransduktoraktivitedit
namespace: molecular_functiondef: ”förmedlar överföringen av en signal från utsidan till insidan av en cell med andra medel än införandet av signalmolekylen själv i cellen.,”
strukturell molekylaktivitet
” verkan av en molekyl som bidrar till den strukturella integriteten hos ett komplex eller en enhet inom eller utanför en cell.”
cytoskelettet
cytoskelettet består av proteinfilament i cytoplasman.
- Wikipedia Cytoskeleton kategori.
extracellulär matrixEdit
”ett skikt bestående huvudsakligen av proteiner (särskilt kollagen) och glykosaminoglykaner (mestadels som proteoglykaner) som bildar ett ark underliggande celler såsom endotelceller och epitelceller., Proteinerna utsöndras av celler i närheten. Som i, men inte begränsat till, de multicellulära djuren.
bindingEdit
”den selektiva, ofta stökiometriska interaktionen av en molekyl med en eller flera specifika platser på en annan molekyl.”För ligander som binder till signaltransducerande receptorer, överväga molekylär funktion termen’ receptorbindning ’(receptoraktivitet, nedan)
Receptoraktivitedit
”kombinera med en extracellulär eller intracellulär budbärare för att initiera en förändring i cellaktivitet.”
Wikipedia-Receptorkategorin.,
proteinbindningedit
”interagerar selektivt med något protein eller proteinkomplex (ett komplex av två eller flera proteiner som kan innefatta andra icke-proteinmolekyler).”
lipid bindingEdit
” interagerar selektivt och icke-kovalent med en lipid.”(GO:0008289)
- Lipidöverföringsproteiner
cellmotilityedit
”alla processer som är involverade i kontrollerad rörelse av en cell.”
exact_synonym:”cell locomotion”
exact_synonym:”cell movement” Obs! se även #motoraktivitet (ovan) för andra proteiner som är involverade i cellmotilitet.,
membran fusionEdit
”sammanfogningen av två lipid bilayers för att bilda ett enda membran.”
cell communicationEdit
” alla processer som förmedlar interaktioner mellan en cell och dess omgivning. Omfattar interaktioner såsom signalering eller fastsättning mellan en cell och en annan cell, mellan en cell och en extracellulär matris, eller mellan en cell och någon annan aspekt av dess miljö.”
reglering av biologisk processEdit
” varje process som modulerar frekvensen, hastigheten eller omfattningen av en biologisk process., Biologiska processer regleras på många sätt; exempel inkluderar kontroll av genuttryck, proteinmodifiering eller interaktion med ett protein eller substrat molekyl.”
utvecklingedit
” den biologiska processen som specifikt syftar till att en organisms progression över tiden från en initial Kondi (t.ex. ett multicellulärt djur, en åldrig vuxen eller en mogen encellig organism).”(”utvecklingsprocess”).
celldifferentieringedit
” processen där relativt ospecialiserade celler, t. ex., embryonala eller regenerativa celler, förvärvar specialiserade strukturella och/eller funktionella egenskaper som karakteriserar cellerna, vävnaderna eller organen i den mogna organismen eller någon annan relativt stabil fas av organismens livshistoria.”
svar på stimulusEdit
” en förändring i tillstånd eller aktivitet hos en cell eller organism (när det gäller rörelse, utsöndring, enzymproduktion, genuttryck etc.) som ett resultat av uppfattningen av en stimulans.”
behaviorEdit
” en organisms specifika åtgärder eller reaktioner som svar på yttre eller inre stimuli., Mönstrad aktivitet hos en hel organism på ett sätt som är beroende av en kombination av organismens inre tillstånd och yttre förhållanden.”
celladhesionedit
”den specifika aalting av processer inom en cell så att dess vitala funktioner markant upphör, snarare än att helt enkelt försämras gradvis över tiden, vilket kulminerar i celldöd.”
transportEdit
” den riktade rörelsen av ämnen (såsom makromolekyler, små molekyler, joner) till, ut ur, inom eller mellan celler.,”
proteintransportör activityEdit
” möjliggör riktad förflyttning av proteiner till, ut ur, inom eller mellan celler.”
Nuclear transportEdit
- importin, nuclear transport factor 2 (NTF2), Ran, exportin
Ion transporter activityEdit
” möjliggör riktad förflyttning av laddade atomer eller små laddade molekyler i, ut ur, inom eller mellan celler.,”
kanal eller porklass transportör activityEdit
” tillåter underlättad diffusion (genom en energioberoende process) genom passage genom en transmembranvatten por eller kanal utan en bärare-medierad mekanism. De uppvisar inte stereospecificitet men kan vara specifika för en viss molekylär art eller klass av molekyler.”
carrier activityEdit
exakt synonym: ”carrier typ transporter”
”Katalys av överföring av ett visst ämne eller en närstående grupp av ämnen från ena sidan av membranet till den andra.,”
permease activityEdit
” katalys av den stereospecifika överföringen av ett substrat över ett biologiskt membran.”
secretionEdit
” den reglerade frisättningen av ett ämne av en cell eller grupp av celler.”
electron transporter activityEdit
” möjliggör riktad rörelse av elektroner till, ut ur, inom eller mellan celler.”
elektron transportEdit
” transporten av elektroner från en elektrondonator till en elektron acceptor.,”(elektronöverföring)
patogenesisedit
”de specifika processer som genererar en organisms förmåga att orsaka sjukdom i en annan.”
Observera att denna term inte bör användas för att kommentera genprodukter som är involverade i värd svar på patogenes. Det bör endast användas för att kommentera de genprodukter som är involverade i generering av patogenes av själva patogenen (virulens).
chaperone regulator activityEdit
”modulerar aktiviteten hos ett molekylärt Chaperon.,”
nukleinsyrabindningedit
” interagerar selektivt med någon nukleinsyra.”
transkription regulator activityEdit
” spelar en roll för att reglera transkription; kan binda en promotor eller förstärkare DNA-sekvens eller interagera med en DNA-bindande transkriptionsfaktor.,”
Kategori:transkriptionsfaktorer
Kategori:transkription coregulatorer; transkription coregulatorer som PELP-1; Coactivator (genetics)
extracellulär struktur organisation och biogenesisEdit
” montering och arrangemang av strukturer i utrymmet utanför den yttersta strukturen av en cell. För celler utan yttre skyddande eller yttre inkapslande strukturer avser detta utrymme utanför plasmamembranet och täcker även värdcellsmiljön utanför en intracellulär parasit.,”
exact_synonym:”extracellular structure organization and biogenesis”
translation regulator activityEdit
” alla ämnen som är involverade i initiering, aktivering, förlängning, förtryck eller uppsägning av polypeptidsyntesen vid ribosomen.”